RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 SLC6A17Q9H1V8 727 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 PRSS16Q9NQE7 514 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM248Q9NWD8 314 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 PCSK1NQ9UHG2 260 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 ANAPC7Q9UJX3 599 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 AP4E1Q9UPM8 1137 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 OR51B4Q9Y5P0 310 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 CREB3O43889 395 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 RETP07949 1114 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 MIPP30301 263 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 HTR7P34969 479 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 PCK1P35558 622 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 ETFBP38117 255 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 VASPP50552 380 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 COPAP53621 1224 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 ARTNQ5T4W7 220 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 SLC36A4Q6YBV0 504 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 TC2NQ8N9U0 490 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 DCAF4L2Q8NA75 395 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 ARHGEF26Q96DR7 871 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 UVRAGQ9P2Y5 699 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF212Q9UDV6 495 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 ABCA7Q8IZY2 2146 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 CHD5Q8TDI0 1954 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 PIEZO1Q92508 2521 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 TTC34A8MYJ7 566 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 MYO1FO00160 1098 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 LRCH4O75427 683 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 EPHB2P29323 1055 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 STK19P49842 368 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 NLRP14Q86W24 1093 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 USP18Q9UMW8 372 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 CYP8B1Q9UNU6 501 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 VPS13AQ96RL7 3174 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 A0A0D9SEW6 157 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM253P0C7T8 217 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 BCKDHBP21953 392 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 TPI1P60174 286 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 GNA12Q03113 381 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 PMS2CLQ68D20 193 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 OR7D4Q8NG98 312 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 PSMB7Q99436 277 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 SPON2Q9BUD6 331 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 MTG2Q9H4K7 406 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 ATP13A1Q9HD20 1204 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 SPTLC3Q9NUV7 552 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 DONSONQ9NYP3 566 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 DNAI1Q9UI46 699 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 LCMT1Q9UIC8 334 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 VPS51Q9UID3 782 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 NEU3Q9UQ49 428 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 DMDP11532 3685 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 FAM186AA6NE01 2351 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 SIN3BO75182 1162 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 DNTTP04053 509 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 ZBTB16Q05516 673 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 SEMA3BQ13214 749 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 ACCSLQ4AC99 568 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 IL31Q6EBC2 164 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 RETSATQ6NUM9 610 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 LPCAT2Q7L5N7 544 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 CACUL1Q86Y37 369 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 SH2D3CQ8N5H7 860 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 NIPA2Q8N8Q9 360 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 BTBD6Q96KE9 485 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 PEBP4Q96S96 227 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 PACSIN1Q9BY11 444 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 MAGEH1Q9H213 219 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 ITM2CQ9NQX7 267 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 SDK1Q7Z5N4 2213 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 NUP205Q92621 2012 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 CBX4O00257 560 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 ATP9BO43861 1147 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 SNAP91O60641 907 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 RAMP2O60895 175 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 NDUFS2O75306 463 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 EPN2O95208 641 aa22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms