RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521865.5

PABPC1-218, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, humanhuman

TSL 2

Gene PABPC1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1-218ENST00000521865 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PABPC1-218ENST00000521865 EXOC3L4Q17RC7 722 aa21.46■■□□□ 1.03
PABPC1-218ENST00000521865 FAM46CQ5VWP2 391 aa21.46■■□□□ 1.03
PABPC1-218ENST00000521865 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PABPC1-218ENST00000521865 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PABPC1-218ENST00000521865 EID2Q8N6I1 236 aa21.46■■□□□ 1.03
PABPC1-218ENST00000521865 ASNSD1Q9NWL6 643 aa21.46■■□□□ 1.03
PABPC1-218ENST00000521865 RWDD2AQ9UIY3 292 aa21.46■■□□□ 1.03
PABPC1-218ENST00000521865 VPS28Q9UK41 221 aa21.46■■□□□ 1.03
PABPC1-218ENST00000521865 DSPP15924 2871 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
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PABPC1-218ENST00000521865 TLR4O00206 839 aa21.45■■□□□ 1.02
PABPC1-218ENST00000521865 RTN2O75298 545 aa21.45■■□□□ 1.02
PABPC1-218ENST00000521865 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
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PABPC1-218ENST00000521865 KRT9P35527 623 aa21.45■■□□□ 1.02
PABPC1-218ENST00000521865 GGCXP38435 758 aa21.45■■□□□ 1.02
PABPC1-218ENST00000521865 PLK1P53350 603 aa21.45■■□□□ 1.02
PABPC1-218ENST00000521865 METAP1P53582 386 aa21.45■■□□□ 1.02
PABPC1-218ENST00000521865 PTK2Q05397 1052 aa21.45■■□□□ 1.02
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PABPC1-218ENST00000521865 POM121L1PQ3SYA9 428 aa21.45■■□□□ 1.02
PABPC1-218ENST00000521865 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa21.45■■□□□ 1.02
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PABPC1-218ENST00000521865 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa21.45■■□□□ 1.02
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PABPC1-218ENST00000521865 WDTC1Q8N5D0 677 aa21.45■■□□□ 1.02
PABPC1-218ENST00000521865 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
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PABPC1-218ENST00000521865 FRS2Q8WU20 508 aa21.45■■□□□ 1.02
PABPC1-218ENST00000521865 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa21.44■■□□□ 1.02
PABPC1-218ENST00000521865 CBX4O00257 560 aa21.44■■□□□ 1.02
PABPC1-218ENST00000521865 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PABPC1-218ENST00000521865 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
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PABPC1-218ENST00000521865 SHBQ15464 509 aa21.44■■□□□ 1.02
PABPC1-218ENST00000521865 DLG2Q15700 870 aa21.44■■□□□ 1.02
PABPC1-218ENST00000521865 CAMK4Q16566 473 aa21.44■■□□□ 1.02
PABPC1-218ENST00000521865 TMPRSS12Q86WS5 348 aa21.44■■□□□ 1.02
PABPC1-218ENST00000521865 OXR1Q8N573 874 aa21.44■■□□□ 1.02
PABPC1-218ENST00000521865 FEM1AQ9BSK4 669 aa21.44■■□□□ 1.02
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PABPC1-218ENST00000521865 MUC3BQ9H195 1237 aa21.44■■□□□ 1.02
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PABPC1-218ENST00000521865 PCDHGC3Q9UN70 934 aa21.44■■□□□ 1.02
PABPC1-218ENST00000521865 HS3ST4Q9Y661 456 aa21.44■■□□□ 1.02
PABPC1-218ENST00000521865 KNL1Q8NG31 2342 aa21.44■■□□□ 1.02
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PABPC1-218ENST00000521865 SLC7A4O43246 635 aa21.43■■□□□ 1.02
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PABPC1-218ENST00000521865 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa21.43■■□□□ 1.02
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PABPC1-218ENST00000521865 PAGE1O75459 146 aa21.42■■□□□ 1.02
PABPC1-218ENST00000521865 CLDN11O75508 207 aa21.42■■□□□ 1.02
PABPC1-218ENST00000521865 DAB1O75553 588 aa21.42■■□□□ 1.02
PABPC1-218ENST00000521865 ERBB2P04626 1255 aa21.42■■□□□ 1.02
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PABPC1-218ENST00000521865 BNIP3Q12983 259 aa21.42■■□□□ 1.02
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PABPC1-218ENST00000521865 OLFML1Q6UWY5 402 aa21.42■■□□□ 1.02
PABPC1-218ENST00000521865 MFSD2AQ8NA29 543 aa21.42■■□□□ 1.02
PABPC1-218ENST00000521865 OR52K2Q8NGK3 314 aa21.42■■□□□ 1.02
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PABPC1-218ENST00000521865 CCDC114Q96M63 670 aa21.41■■□□□ 1.02
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PABPC1-218ENST00000521865 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa21.41■■□□□ 1.02
PABPC1-218ENST00000521865 PLCB1Q9NQ66 1216 aa21.41■■□□□ 1.02
PABPC1-218ENST00000521865 PPM1HQ9ULR3 514 aa21.41■■□□□ 1.02
PABPC1-218ENST00000521865 DMTF1Q9Y222 760 aa21.41■■□□□ 1.02
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