RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513344.1

USP45-213, Transcript of ubiquitin specific peptidase 45, human

TSL 3

Gene USP45, Length 801 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP45-213	ENST00000513344	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	NCK2	O43639	380 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	MYL3	P08590	195 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	ITGB8	P26012	769 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	ADPRH	P54922	357 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	TRAF2	Q12933	501 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	HLF	Q16534	295 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	DGKH	Q86XP1	1220 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	GDF15	Q99988	308 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	CA14	Q9ULX7	337 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	KIF28P	B7ZC32	967 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	NTSR2	O95665	410 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	ANXA6	P08133	673 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	IGFBP2	P18065	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	KLRK1	P26718	216 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	AVPR1A	P37288	418 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	CYP2J2	P51589	502 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	FOXL2	P58012	376 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	TRABD2A	Q86V40	505 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	KDM1B	Q8NB78	822 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344		A0A1B0GUV1	79 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	PCDH17	O14917	1159 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	ASAP2	O43150	1006 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	PPP1R3D	O95685	299 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	SLC5A1	P13866	664 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	TNFSF4	P23510	183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	PPP3CC	P48454	512 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	DUSP6	Q16828	381 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	FBXL22	Q6P050	247 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	CYP3A4	P08684	503 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	CYP3A7	P24462	503 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	HNF4G	Q14541	408 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	RAB30	Q15771	203 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	CEP76	Q8TAP6	659 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	MECR	Q9BV79	373 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	HIPK3	Q9H422	1215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	CDH22	Q9UJ99	828 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP45-213	ENST00000513344	KCNJ13	O60928	360 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP45-213	ENST00000513344	GLP2R	O95838	553 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP45-213	ENST00000513344	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
USP45-213	ENST00000513344	NUDT6	P53370	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP45-213	ENST00000513344	RHAG	Q02094	409 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP45-213	ENST00000513344	ZBTB16	Q05516	673 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP45-213	ENST00000513344	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
USP45-213	ENST00000513344	KIF19	Q2TAC6	998 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP45-213	ENST00000513344	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP45-213	ENST00000513344	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP45-213	ENST00000513344	DUX5	Q96PT3	197 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP45-213	ENST00000513344	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68

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