RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-222ENST00000512014 WDR59Q6PJI9 974 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 RGL4Q8IZJ4 473 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 AADATQ8N5Z0 425 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 C3orf20Q8ND61 904 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 CBX8Q9HC52 389 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 ADAM22Q9P0K1 906 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 MYO6Q9UM54 1294 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 PCNX2A6NKB5 2137 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 A0A1W2PQC6 194 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 LRRC53A6NM62 1247 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 SIGLEC16A6NMB1 481 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 FAM72CH0Y354 149 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 ARHGAP33O14559 1287 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 GIPC1O14908 333 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 SNAP91O60641 907 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 KCNK5O95279 499 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 SEMA4FO95754 770 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 DNTTP04053 509 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 FERP16591 822 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 ADRA1BP35368 520 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 MAPK8P45983 427 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 NSFP46459 744 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 OXCT1P55809 520 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 CDO1Q16878 200 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 WDR45BQ5MNZ6 344 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 SYCP2LQ5T4T6 812 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 FAM72AQ5TYM5 149 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 FAM72DQ6L9T8 149 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 USP30Q70CQ3 517 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 STRADAQ7RTN6 431 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 FAM72BQ86X60 149 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 SH2D3CQ8N5H7 860 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 CCDC185Q8N715 623 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 FAM131CQ96AQ9 280 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 BTBD1Q9H0C5 482 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 PCED1AQ9H1Q7 454 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 TMEM51Q9NW97 253 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 SARDHQ9UL12 918 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 HS3ST2Q9Y278 367 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 A0A1W2PP55 124 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 MEI4A8MW99 385 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 K7ERQ8 282 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 RNF103O00237 685 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 ZMPSTE24O75844 475 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 CALB1P05937 261 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 IGHV4-34P06331 123 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 KRT3P12035 628 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 SRCP12931 536 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 GLDCP23378 1020 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 SDC4P31431 198 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 SLC8A1P32418 973 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 DRD3P35462 400 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 PBX1P40424 430 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 OGDHQ02218 1023 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 GRIK2Q13002 908 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 SEMA3BQ13214 749 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 DLG2Q15700 870 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 ACAD10Q6JQN1 1059 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 RABEPKQ7Z6M1 372 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 PIP4P1Q86T03 277 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 LUZP1Q86V48 1076 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 NLRP14Q86W24 1093 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 DNAAF5Q86Y56 855 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 MCOLN2Q8IZK6 566 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 OR7D4Q8NG98 312 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 FAM172AQ8WUF8 416 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 BIRC7Q96CA5 298 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 OSBPL2Q9H1P3 480 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 NEUROG2Q9H2A3 272 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 EBF2Q9HAK2 575 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 SGK2Q9HBY8 427 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 NDFIP2Q9NV92 336 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 FBXL12Q9NXK8 326 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 AIPL1Q9NZN9 384 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 VPS51Q9UID3 782 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 VPS28Q9UK41 221 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 SCML1Q9UN30 329 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 TPRP12270 2363 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 PLXNA2O75051 1894 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 A0A1B0GTW7 788 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 SRGAP2O75044 1071 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP2-222ENST00000512014 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms