RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-215	ENST00000506510	COG5	Q9UP83	839 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510		A6NLC8	198 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	KIF28P	B7ZC32	967 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510		B9A039	149 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	TNFRSF6B	O95407	300 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	GLUL	P15104	373 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	TNFRSF1B	P20333	461 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	CNTF	P26441	200 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	LINC00205	P59089	165 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	SHC2	P98077	582 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	ROR1	Q01973	937 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	FHL1	Q13642	323 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	TWIST1	Q15672	202 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	CCNG2	Q16589	344 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	BTBD16	Q32M84	506 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	MIDN	Q504T8	468 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	PIM3	Q86V86	326 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	MMP21	Q8N119	569 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	ZNF347	Q96SE7	839 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	WAC	Q9BTA9	647 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510		A0A0G2JK05	382 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510		B4DGG1	531 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	TULP3	O75386	442 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	SGPL1	O95470	568 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	CKMT1A	P12532	417 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	ATP1A3	P13637	1013 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	XBP1	P17861	261 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	LIFR	P42702	1097 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	PFKFB4	Q16877	469 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	ZACN	Q401N2	412 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	EME1	Q96AY2	570 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	MECR	Q9BV79	373 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	THSD1	Q9NS62	852 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	DACT1	Q9NYF0	836 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	LRFN1	Q9P244	771 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PDE4D-215	ENST00000506510	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-215	ENST00000506510	FSD2	A1L4K1	749 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-215	ENST00000506510	LGALS16	A8MUM7	142 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-215	ENST00000506510	ACKR2	O00590	384 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-215	ENST00000506510	NDUFB8	O95169	186 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-215	ENST00000506510	TOMM40	O96008	361 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-215	ENST00000506510	TGM2	P21980	687 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-215	ENST00000506510	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-215	ENST00000506510	GRK5	P34947	590 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-215	ENST00000506510	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-215	ENST00000506510	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-215	ENST00000506510	TLE3	Q04726	772 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-215	ENST00000506510	FOXO1	Q12778	655 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-215	ENST00000506510	SPARCL1	Q14515	664 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-215	ENST00000506510	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-215	ENST00000506510	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-215	ENST00000506510	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-215	ENST00000506510	SNX32	Q86XE0	403 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-215	ENST00000506510	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-215	ENST00000506510	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-215	ENST00000506510	FAM71B	Q8TC56	605 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-215	ENST00000506510	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-215	ENST00000506510	NLRP4	Q96MN2	994 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PDE4D-215	ENST00000506510	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58

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