RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC24A5Q71RS6 500 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 UBALD2Q8IYN6 164 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 C10orf53Q8N6V4 93 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 IGSF22Q8N9C0 903 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 NAXEQ8NCW5 288 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 IFI44Q8TCB0 444 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 CCT6BQ92526 530 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 BAP1Q92560 729 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 STAMQ92783 540 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 RAB7BQ96AH8 199 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 CAMK1GQ96NX5 476 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 C16orf70Q9BSU1 422 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM15Q9C019 465 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM117Q9H0C3 514 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF38Q9H0F5 515 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 TLR9Q9NR96 1032 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 SPG21Q9NZD8 308 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 SELENONQ9NZV5 590 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 MAD2L2Q9UI95 211 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 NFASCO94856 1347 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 CCNDBP1O95273 360 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM16O95361 564 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 SYF2O95926 243 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 INSRRP14616 1297 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 IL9P15248 144 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 ITGA2P17301 1181 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 CCND1P24385 295 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 CTNNA2P26232 953 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 GARSP41250 739 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 CCR10P46092 362 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 NRIP1P48552 1158 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 PHKG1Q16816 387 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 FBXO47Q5MNV8 452 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF425Q6IV72 752 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 FOXR2Q6PJQ5 311 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 GLB1LQ6UWU2 654 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 NIPA1Q7RTP0 329 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 MICU3Q86XE3 530 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 ARHGAP24Q8N264 748 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 ALLCQ8N6M5 410 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 AVL9Q8NBF6 648 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 XXYLT1Q8NBI6 393 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC8CQ8TDW0 803 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 TUBGCP3Q96CW5 907 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 IFT74Q96LB3 600 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 MXRA8Q9BRK3 442 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 TIPINQ9BVW5 301 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 NMRK1Q9NWW6 199 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM260Q9NX78 707 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 SPATA2Q9UM82 520 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 GPR52Q9Y2T5 361 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 E2F8A0AVK6 867 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 CENPBD1B2RD01 187 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 C5orf67F2Z3F1 127 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 F5H423 210 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 M0R296 226 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 BTN3A1O00481 513 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 PFDN6O15212 129 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF202O95125 648 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 PLGP00747 810 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 MAPK1P28482 360 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 CD52P31358 61 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 SFNP31947 248 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 PCK1P35558 622 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 SLCO1A2P46721 670 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 JAK3P52333 1124 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 EMP3P54852 163 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 KCNJ10P78508 379 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 SCRN3Q0VDG4 424 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 DUPD1Q68J44 220 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 UNC13DQ70J99 1090 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 RAB11FIP2Q7L804 512 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 FBXL6Q8N531 539 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 NIPA2Q8N8Q9 360 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 DNAAF3Q8N9W5 541 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 OR56B2PQ8NGI1 322 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF507Q8TCN5 953 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 KCNG4Q8TDN1 519 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 POMGNT1Q8WZA1 660 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 PKP4Q99569 1192 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 ACAT2Q9BWD1 397 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 GRIP2Q9C0E4 1043 aa4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.3 ms