RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492895.1

ANKRD28-211, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-211ENST00000492895 SERTAD4Q9NUC0 356 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 FBXO40Q9UH90 709 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 NRBP1Q9UHY1 535 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa3.65□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 ACACBO00763 2458 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 A0A0D9SFI3 127 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 ASB14A6NK59 587 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 NXPH3O95157 252 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 TIMP1P01033 207 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 FGAP02671 866 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 PDE1AP54750 535 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 KRT17Q04695 432 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 E2F2Q14209 437 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 USH1GQ495M9 461 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 C3orf38Q5JPI3 329 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 AMIGO2Q86SJ2 522 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 GAS2L3Q86XJ1 694 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 KRT78Q8N1N4 520 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM199Q8N511 208 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 KLHDC9Q8NEP7 349 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 PJA1Q8NG27 643 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 MAML1Q92585 1016 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 EVI5LQ96CN4 794 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 MESP1Q9BRJ9 268 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 APOL5Q9BWW9 433 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 UBA5Q9GZZ9 404 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 CPVLQ9H3G5 476 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 HIPK3Q9H422 1215 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 VAT1LQ9HCJ6 419 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 ARHGEF3Q9NR81 526 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 SERTAD3Q9UJW9 196 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 ADAM21Q9UKJ8 722 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM50BQ9Y247 325 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 SNX13Q9Y5W8 968 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 WNT6Q9Y6F9 365 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 UMODL1Q5DID0 1318 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 TTC41PQ6P2S7 1318 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 WDFY4Q6ZS81 3184 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 PSME4Q14997 1843 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 NAV2Q8IVL1 2488 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 NCOR2Q9Y618 2525 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM233B4DJY2 109 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 ATP2A1O14983 1001 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 CTAGE5O15320 804 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 TLR5O60602 858 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 RASSF9O75901 435 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 FGBP02675 491 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 ICAM1P05362 532 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 MYL1P05976 194 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM163BP0C2L3 166 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 EBLN1P0CF75 366 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 TOP1P11387 765 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 JUPP14923 745 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 MYOGP15173 224 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 NDUFB7P17568 137 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 PPIFP30405 207 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 ALDH9A1P49189 494 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 CCT8P50990 548 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 OAZ1P54368 228 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 TBX4P57082 545 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 SP2Q02086 613 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.835e-6■■■□□ 15.6
ANKRD28-211ENST00000492895 ITGA7Q13683 1181 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 PLA1AQ53H76 456 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF618Q5T7W0 954 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 ARHGAP40Q5TG30 622 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 DCAF12L1Q5VU92 463 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF788Q6ZQV5 615 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 MFSD6Q6ZSS7 791 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 SEPT14Q6ZU15 432 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 CHST3Q7LGC8 479 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 MAVSQ7Z434 540 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 DEFB128Q7Z7B8 93 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 C11orf96Q7Z7L8 435 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-211ENST00000492895 TLK2Q86UE8 772 aa3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms