RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 BICD1Q96G01 975 aa3.02□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 SFXN1Q9H9B4 322 aa3.02□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 OGDHLQ9ULD0 1010 aa3.02□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 L1RE1Q9UN81 338 aa3.02□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRSS21Q9Y6M0 314 aa3.02□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.01□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa3.01□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC01553A4QN01 128 aa3.01□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 STMND1H3BQB6 276 aa3.01□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 LDB2O43679 373 aa3.01□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 SERPINI2O75830 405 aa3.01□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 AMBPP02760 352 aa3.01□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 CHRNA5P30532 468 aa3.01□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 STAT1P42224 750 aa3.01□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa3.01□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 AAGABQ6PD74 315 aa3.01□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 C16orf89Q6UX73 402 aa3.01□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF497Q6ZNH5 498 aa3.01□□□□□ -1.93
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CACNA2D1-211ENST00000486539 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa3.01□□□□□ -1.93
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CACNA2D1-211ENST00000486539 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa3.01□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 SNX22Q96L94 193 aa3.01□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 NUDT22Q9BRQ3 303 aa3.01□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 LRRC27Q9C0I9 530 aa3.01□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 M0QZQ0 153 aa3□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 P2RY10O00398 339 aa3□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 COQ9O75208 318 aa3□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 KAT7O95251 611 aa3□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 MYZAPP0CAP1 466 aa3□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF284Q2VY69 593 aa3□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 RETSATQ6NUM9 610 aa3□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 ANKRD44Q8N8A2 993 aa3□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF333Q96JL9 665 aa3□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 FEM1CQ96JP0 617 aa3□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 EVA1AQ9H8M9 152 aa3□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF287Q9HBT7 754 aa3□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa3□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
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CACNA2D1-211ENST00000486539 OR2W5A6NFC9 320 aa2.99□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 EYA2O00167 538 aa2.99□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 KIF3BO15066 747 aa2.99□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGFBP2P18065 325 aa2.99□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 MYF6P23409 242 aa2.99□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 AVPR1AP37288 418 aa2.99□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 PEX5P50542 639 aa2.99□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 WDR93Q6P2C0 686 aa2.99□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM71Q6P5X7 295 aa2.99□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 RNF44Q7L0R7 432 aa2.99□□□□□ -1.93
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CACNA2D1-211ENST00000486539 KCNK9Q9NPC2 374 aa2.99□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A0U1RQJ8 604 aa2.98□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 GXYLT2A0PJZ3 443 aa2.98□□□□□ -1.93
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CACNA2D1-211ENST00000486539 CLGNO14967 610 aa2.98□□□□□ -1.93
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CACNA2D1-211ENST00000486539 MST1P26927 711 aa2.98□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 CACNB3P54284 484 aa2.98□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 SHC2P98077 582 aa2.98□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
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CACNA2D1-211ENST00000486539 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa2.98□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 MRNIPQ6NTE8 343 aa2.98□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 MDGA2Q7Z553 956 aa2.98□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 P2RY8Q86VZ1 359 aa2.98□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC35F5Q8WV83 523 aa2.98□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 NPIPB3Q92617 1050 aa2.98□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa2.98□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 TBC1D23Q9NUY8 699 aa2.98□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 FBXO28Q9NVF7 368 aa2.98□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRO0461Q9UI25 63 aa2.98□□□□□ -1.93
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CACNA2D1-211ENST00000486539 MYF5P13349 255 aa2.97□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPP3CCP48454 512 aa2.97□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 DLG1Q12959 904 aa2.97□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATP1A4Q13733 1029 aa2.97□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM88Q6PEY1 159 aa2.97□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 USP17L6PQ6QN14 398 aa2.97□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa2.97□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 TUBA1AQ71U36 451 aa2.97□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRT27Q7Z3Y8 459 aa2.97□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAB21L3Q8N8X9 362 aa2.97□□□□□ -1.93
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