RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484528.1

USP40-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-215ENST00000484528 SNX16P57768 344 aa22.18■■□□□ 1.14
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USP40-215ENST00000484528 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
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USP40-215ENST00000484528 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
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USP40-215ENST00000484528 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa22.14■■□□□ 1.13
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USP40-215ENST00000484528 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 SERAC1Q96JX3 654 aa22.14■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.14■■□□□ 1.13
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