RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 EFHC2Q5JST6 749 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 C9orf64Q5T6V5 341 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 PTPRN2Q92932 1015 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D31Q96DN5 1066 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 RETREG1Q9H6L5 497 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 NDFIP2Q9NV92 336 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa21.49■■□□□ 1.03
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ACTB-211ENST00000480301 SNAP91O60641 907 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 LRP3O75074 770 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 CYP1A2P05177 515 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 RHOQP17081 205 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 TPMTP51580 245 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 RPS14P62263 151 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 SEMA3BQ13214 749 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 SLC36A4Q6YBV0 504 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 ZNF783Q6ZMS7 281 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 CACUL1Q86Y37 369 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 TMEFF1Q8IYR6 380 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 KIAA2013Q8IYS2 634 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 OR7D4Q8NG98 312 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 FRS2Q8WU20 508 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 ARHGEF26Q96DR7 871 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 CHP1Q99653 195 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 TMEM248Q9NWD8 314 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 VPS51Q9UID3 782 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 DOCK4Q8N1I0 1966 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 ATP9BO43861 1147 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 IGLV3-19P01714 112 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 NNMTP40261 264 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 GALCP54803 685 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 KRT83P78385 493 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 SLC18A3Q16572 532 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 SPDYCQ5MJ68 293 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 LPCAT2Q7L5N7 544 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 PEBP4Q96S96 227 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 FAM129BQ96TA1 746 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 SEMA4GQ9NTN9 838 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 PCSK1NQ9UHG2 260 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A13Q9UJS0 675 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 LRCH4O75427 683 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 RNF8O76064 485 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 MT-CO1P00395 513 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 ACADMP11310 421 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 CD6P30203 668 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 MIPP30301 263 aa21.47■■□□□ 1.03
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ACTB-211ENST00000480301 MAPKAPK2P49137 400 aa21.47■■□□□ 1.03
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ACTB-211ENST00000480301 CREB5Q02930 508 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 GNA12Q03113 381 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB16Q05516 673 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 CSRP2Q16527 193 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 PLA2G2CQ5R387 149 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 CNGA4Q8IV77 575 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 SH2D3CQ8N5H7 860 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 DEFB119Q8N690 84 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 DCAF4L2Q8NA75 395 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 NUP85Q9BW27 656 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 HS3ST2Q9Y278 367 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 ZMPSTE24O75844 475 aa21.46■■□□□ 1.03
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ACTB-211ENST00000480301 VAV1P15498 845 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 GLDCP23378 1020 aa21.46■■□□□ 1.03
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ACTB-211ENST00000480301 MPLP40238 635 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 ZNF75DP51815 510 aa21.46■■□□□ 1.03
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ACTB-211ENST00000480301 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
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ACTB-211ENST00000480301 STK40Q8N2I9 435 aa21.46■■□□□ 1.03
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ACTB-211ENST00000480301 SPON2Q9BUD6 331 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 PACSIN1Q9BY11 444 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 DNAI1Q9UI46 699 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 USP18Q9UMW8 372 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 AP4E1Q9UPM8 1137 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 THADAQ6YHU6 1953 aa21.46■■□□□ 1.03
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