RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468086.1

RBM39-226, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 4

Gene RBM39, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-226	ENST00000468086	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	ISCU	Q9H1K1	167 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086		H0YGN5	161 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	GRM8	O00222	908 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	POF1B	Q8WVV4	589 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	ARRDC3	Q96B67	414 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	C3orf49	Q96BT1	292 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	SEPT4	O43236	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	CYP2J2	P51589	502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	ZBTB16	Q05516	673 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	C5orf22	Q49AR2	442 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	MTFR2	Q6P444	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	GPSM1	Q86YR5	675 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	DPP10	Q8N608	796 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	KDM1B	Q8NB78	822 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	SELENON	Q9NZV5	590 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	CBSL	P0DN79	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	ARSB	P15848	533 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	CHN1	P15882	459 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	KLRC2	P26717	231 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	GSTM2	P28161	218 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	ARRB2	P32121	409 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	CBS	P35520	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	MLH1	P40692	756 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	AADACL2	Q6P093	401 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	CCDC25	Q86WR0	208 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	FSIP1	Q8NA03	581 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	ASB5	Q8WWX0	329 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	ZNF333	Q96JL9	665 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	FRG2B	Q96QU4	278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	ZPBP	Q9BS86	351 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086		Q9N2J8	555 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-226	ENST00000468086	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-226	ENST00000468086	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-226	ENST00000468086	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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