RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		18.22	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	MTG2	Q9H4K7	406 aa		18.22	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	DNAI1	Q9UI46	699 aa		18.22	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		18.22	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	NENF	Q9UMX5	172 aa		18.22	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		18.22	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		18.21	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902		A0A0D9SEW6	157 aa		18.21	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	TTC34	A8MYJ7	566 aa		18.21	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	LRCH4	O75427	683 aa		18.21	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	RHOQ	P17081	205 aa		18.21	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	ACAP1	Q15027	740 aa		18.21	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		18.21	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	KBTBD6	Q86V97	674 aa		18.21	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		18.21	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	DCLK2	Q8N568	766 aa		18.21	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		18.21	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	OR7D4	Q8NG98	312 aa		18.21	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	ALG14	Q96F25	216 aa		18.21	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		18.21	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	PEBP4	Q96S96	227 aa		18.21	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	USP18	Q9UMW8	372 aa		18.21	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		18.2	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	ILVBL	A1L0T0	632 aa		18.2	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	CBX4	O00257	560 aa		18.2	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	DAPK3	O43293	454 aa		18.2	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	ACADM	P11310	421 aa		18.2	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	TPI1	P60174	286 aa		18.2	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	ELF2	Q15723	593 aa		18.2	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	ARTN	Q5T4W7	220 aa		18.2	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	IL31	Q6EBC2	164 aa		18.2	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		18.2	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	SPC24	Q8NBT2	197 aa		18.2	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	OR2T3	Q8NH03	318 aa		18.2	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		18.2	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	MYO19	Q96H55	970 aa		18.2	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		18.2	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	ZWILCH	Q9H900	591 aa		18.2	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	CD248	Q9HCU0	757 aa		18.2	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		18.2	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		18.2	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		18.2	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		18.2	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		18.2	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		18.2	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		18.19	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	SNAP91	O60641	907 aa		18.19	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	ZNF217	O75362	1048 aa		18.19	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	TMEM253	P0C7T8	217 aa		18.19	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	PCK1	P35558	622 aa		18.19	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	P2RY2	P41231	377 aa		18.19	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	MAPKAPK2	P49137	400 aa		18.19	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	GNA12	Q03113	381 aa		18.19	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	CA9	Q16790	459 aa		18.19	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		18.19	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		18.19	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		18.19	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	C11orf74	Q86VG3	221 aa		18.19	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		18.19	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	FRMD1	Q8N878	549 aa		18.19	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		18.19	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	KDM1B	Q8NB78	822 aa		18.19	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	HSPH1	Q92598	858 aa		18.19	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	PANX2	Q96RD6	677 aa		18.19	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		18.19	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		18.19	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	VPS51	Q9UID3	782 aa		18.19	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		18.19	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		18.18	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		18.18	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	BNIP3L	O60238	219 aa		18.18	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	SIN3B	O75182	1162 aa		18.18	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	RHOBTB1	O94844	696 aa		18.18	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	BCKDHB	P21953	392 aa		18.18	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	COPA	P53621	1224 aa		18.18	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		18.18	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		18.18	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	LINGO4	Q6UY18	593 aa		18.18	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	NLRP14	Q86W24	1093 aa		18.18	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		18.18	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	PSMB7	Q99436	277 aa		18.18	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		18.18	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	FBRS	Q9HAH7	460 aa		18.18	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		18.18	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		18.18	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	RAMP2	O60895	175 aa		18.17	■□□□□ 0.5
USP19-210	ENST00000465902	NDUFS2	O75306	463 aa		18.17	■□□□□ 0.5

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