RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 STRADAQ7RTN6 431 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 NLRP14Q86W24 1093 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 OR7D4Q8NG98 312 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2T3Q8NH03 318 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC26Q8TAB7 109 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 FRS2Q8WU20 508 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 UCMAQ8WVF2 138 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGEF26Q96DR7 871 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 BTBD6Q96KE9 485 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 C1orf74Q96LT6 269 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 MCEEQ96PE7 176 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 HAPLN3Q96S86 360 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 CHP1Q99653 195 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 FEM1AQ9BSK4 669 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 EDEM3Q9BZQ6 932 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 KLC2Q9H0B6 622 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 RBSNQ9H1K0 784 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 ISCUQ9H1K1 167 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 ITM2CQ9NQX7 267 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 SEMA4GQ9NTN9 838 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 SERGEFQ9UGK8 458 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 FZD10Q9ULW2 581 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 NENFQ9UMX5 172 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 ITIH6Q6UXX5 1313 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 PLK4O00444 970 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 RTN2O75298 545 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 ZMPSTE24O75844 475 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 LRIG2O94898 1065 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF806P0C7X5 589 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 GZMAP12544 262 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 ITPKAP23677 461 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 SDC4P31431 198 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 ACSL1P33121 698 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 ACVRL1P37023 503 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 MPLP40238 635 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 TPMTP51580 245 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 CDH4P55283 916 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 ZBED6P86452 979 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 ECT2LQ008S8 904 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 CREB5Q02930 508 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 RABGAP1LQ5R372 815 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 PRR23CQ6ZRP0 262 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 STK40Q8N2I9 435 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 NETO2Q8NC67 525 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 MSANTD4Q8NCY6 345 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 VOPP1Q96AW1 172 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 SIPA1Q96FS4 1042 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 VCPIP1Q96JH7 1222 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 NUP58Q9BVL2 599 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 PACSIN1Q9BY11 444 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 THAP2Q9H0W7 228 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 OSBPL2Q9H1P3 480 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 MYO1AQ9UBC5 1043 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 GMEB2Q9UKD1 530 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 SARDHQ9UL12 918 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB23Q9ULC3 237 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 USP18Q9UMW8 372 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 PLA2G4CQ9UP65 541 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM191CA6NGB0 347 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 C10orf142B7Z368 130 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 NPC1O15118 1278 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 MID1O15344 667 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 CLDN11O75508 207 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 RHOBTB1O94844 696 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 CAVIN2O95810 425 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV3-19P01714 112 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 ASLP04424 464 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 SERPING1P05155 500 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 CTSLP07711 333 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 RHOCP08134 193 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 SRCP12931 536 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 IL1R2P27930 398 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms