RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 EFNA2O43921 213 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 NXPH3O95157 252 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 PDE8BO95263 885 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 AIFM1O95831 613 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 TSHBP01222 138 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 IFNA5P01569 189 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 IGKV4-1P06312 121 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 KLK1P06870 262 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 CSF1RP07333 972 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 CYC1P08574 325 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 ITGA5P08648 1049 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 HOXB5P09067 269 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 THRAP10827 490 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 GCSHP23434 173 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 ABCD3P28288 659 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 BTCP35070 178 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 SFTPDP35247 375 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 SOX5P35711 763 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 LIPAP38571 399 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 PCYT1AP49585 367 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 CARSP49589 748 aaKnown RBP-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 HTR6P50406 440 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 WNT3P56703 355 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 SLC37A1P57057 533 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 ERVPABLB-1P60509 514 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 PPP2CBP62714 309 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 PPP2CAP67775 309 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 SATB1Q01826 763 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 CENPCQ03188 943 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 PDE4CQ08493 712 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 DMPKQ09013 629 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 IRF4Q15306 451 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 TSC22D1Q15714 1073 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 TYSND1Q2T9J0 566 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 SOHLH1Q5JUK2 328 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 C6orf52Q5T4I8 152 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF618Q5T7W0 954 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 OR2T5Q6IEZ7 315 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 SPAG11AQ6PDA7 123 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 RABEPKQ7Z6M1 372 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 CD163Q86VB7 1156 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 RHOT1Q8IXI2 618 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 GALNT12Q8IXK2 581 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 AMOTL1Q8IY63 956 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 PRR22Q8IZ63 422 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 LINC00518Q8N0U6 118 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 CLIP4Q8N3C7 705 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 FBXO39Q8N4B4 442 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 FBXL6Q8N531 539 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF491Q8N8L2 437 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 PNPLA1Q8N8W4 532 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 KBTBD3Q8NAB2 608 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 TTC16Q8NEE8 873 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 GPR156Q8NFN8 814 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 OR5L1Q8NGL2 311 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 OR2T29Q8NH02 315 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 PLEKHO2Q8TD55 490 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 SCARB1Q8WTV0 552 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 GAB3Q8WWW8 586 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF606Q8WXB4 792 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 NRGNQ92686 78 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 STAMQ92783 540 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 TSPAN17Q96FV3 270 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 SETDB2Q96T68 719 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 FOXC2Q99958 501 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 TBL1YQ9BQ87 522 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 HSPB9Q9BQS6 159 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 BTBD2Q9BX70 525 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM222Q9H0R3 208 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 PCDHAC1Q9H158 963 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 SLC26A1Q9H2B4 701 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 SMURF2Q9HAU4 748 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 PRDM7Q9NQW5 492 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 PLA2G3Q9NZ20 509 aa-1.89□□□□□ -2.71
SNORD54-201ENST00000459159 MOCS1Q9NZB8 636 aa-1.89□□□□□ -2.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms