RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 BPIFB4P59827 614 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 PDCLQ13371 301 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 HS1BP3Q53T59 392 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 BHLHA9Q7RTU4 235 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 ADIPOR2Q86V24 386 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 NEK11Q8NG66 645 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 OR2T34Q8NGX1 318 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 NOX5Q96PH1 765 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 SPAG5Q96R06 1193 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 OMDQ99983 421 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 CYTH4Q9UIA0 394 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 CLEC4EQ9ULY5 219 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 NUMA1Q14980 2115 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 FAM47DPA6NHR8 397 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 LRRC10BA6NIK2 292 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 F8VZ95 297 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 SART1O43290 800 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 GABBR2O75899 941 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 C1QL1O75973 258 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 GFPT2O94808 682 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 ACTN2P35609 894 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 IL9RQ01113 521 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 ARID5BQ14865 1188 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 NR1I3Q14994 352 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 MFN1Q8IWA4 741 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 DRC7Q8IY82 874 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 FAM71AQ8IYT1 594 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 SCML4Q8N228 414 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 IRGQQ8WZA9 623 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 AZIN2Q96A70 460 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 STK33Q9BYT3 514 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 GANQ9H2C0 597 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 TJP2Q9UDY2 1190 aa12.05□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 KCNK3O14649 394 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 EPHB6O15197 1021 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 TBL1XO60907 577 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 ADH1BP00325 375 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 IGHV4-34P06331 123 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 CYP11B1P15538 503 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 NNMTP40261 264 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 CCR5P51681 352 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 SEMG2Q02383 582 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 OVGP1Q12889 678 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 CDH18Q13634 790 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 RTP5Q14D33 572 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 CST6Q15828 149 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 MEA1Q16626 185 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 HES3Q5TGS1 186 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 OR6B2Q6IFH4 312 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 LAYNQ6UX15 382 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 TMC6Q7Z403 805 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 ZNF605Q86T29 641 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 ZNF366Q8N895 744 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 SPC24Q8NBT2 197 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 SAP25Q8TEE9 199 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 SLC6A18Q96N87 628 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 CPXM1Q96SM3 734 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 COX16Q9P0S2 106 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 PCDHGC3Q9UN70 934 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 SHROOM3Q8TF72 1996 aa12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 GRAP2O75791 330 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 ITPKBP27987 946 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 CDC25BP30305 580 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 STAT1P42224 750 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 ACADVLP49748 655 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 GALCP54803 685 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 UCNP55089 124 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 E2F1Q01094 437 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 KCNT1Q5JUK3 1230 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 PIK3R6Q5UE93 754 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 NCEH1Q6PIU2 408 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 GPR155Q7Z3F1 870 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms