RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 AATKQ6ZMQ8 1374 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1W2PQF6 199 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1W2PS29 197 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 OR2A25A4D2G3 310 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 URADA6NGE7 173 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 C9orf118A6NHY6 69 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 TTC36A6NLP5 189 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRC53A6NM62 1247 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 MATN2O00339 956 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 PRAMEF10O60809 474 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 MFAP3LO75121 409 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 RECQL4O94761 1208 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 CYP4B1P13584 511 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 C6P13671 934 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 GABRB1P18505 474 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 CPT2P23786 658 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 IRAK1P51617 712 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 STAT2P52630 851 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 EPHB3P54753 998 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 RPS7P62081 194 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 CRY2Q49AN0 593 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 C5orf22Q49AR2 442 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF667Q5HYK9 610 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 KRBOX4Q5JUW0 171 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 METRNLQ641Q3 311 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 GJB7Q6PEY0 223 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 MICALCLQ6ZW33 695 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 SYT12Q8IV01 421 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 Q8NA96 180 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 BEND2Q8NDZ0 799 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 SNX19Q92543 992 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM136AQ96C01 138 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 RSPRY1Q96DX4 576 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 C1orf74Q96LT6 269 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 DEF6Q9H4E7 631 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 GCM1Q9NP62 436 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 ADPRHL2Q9NX46 363 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 NTMQ9P121 344 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 HSPB7Q9UBY9 170 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 MKLN1Q9UL63 735 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 NENFQ9UMX5 172 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 BTBD3Q9Y2F9 522 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 CAPN7Q9Y6W3 813 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 CEP164Q9UPV0 1460 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 AOX1Q06278 1338 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A0U1RQK1 487 aa4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1B0GTW7 788 aa4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF320A2RRD8 509 aa4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM24O15164 1050 aa4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 LIASO43766 372 aa4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 TACC1O75410 805 aa4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 IPO13O94829 963 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 VNN1O95497 513 aa4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 GPANK1O95872 356 aa4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 TUBBP07437 444 aa4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 GALTP07902 379 aa4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 HLA-DPA1P20036 260 aa4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 FGFR4P22455 802 aa4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 PTAFRP25105 342 aa4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 FMO4P31512 558 aa4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 CXCR5P32302 372 aa4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 KIF5BP33176 963 aa4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 MCM7P33993 719 aa4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 CD97P48960 835 aa4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 MFAP4P55083 255 aa4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 HSD11B2P80365 405 aa4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 FPGSQ05932 587 aa4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 CAMK2DQ13557 499 aa4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 DNASE1L3Q13609 305 aa4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC18A3Q16572 532 aa4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CBX1P4-201ENST00000439415 PARP10Q53GL7 1025 aa4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms