RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436881.2

C9orf172-201, Transcript of Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene C9orf172, Length 4,387 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172-201ENST00000436881 NOMO2Q5JPE7 1267 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 ANKS6Q68DC2 871 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 INPP5DQ92835 1189 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 LPPQ93052 612 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 C17orf80Q9BSJ5 609 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 B3GNT5Q9BYG0 378 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 FZD8Q9H461 694 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 ENTPD5O75356 428 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 CCNB1P14635 433 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 ECHS1P30084 290 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 DSG1Q02413 1049 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 GRIK3Q13003 919 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 KRT72Q14CN4 511 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 EMC10Q5UCC4 262 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 SLC4A11Q8NBS3 891 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 ADAM28Q9UKQ2 775 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 SLC12A4Q9UP95 1085 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 LRP6O75581 1613 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 CLDN5O00501 218 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 TPST1O60507 370 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 JAG1P78504 1218 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 MBTD1Q05BQ5 628 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF284Q2VY69 593 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 SNX30Q5VWJ9 437 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 SLC26A9Q7LBE3 791 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 ANKRD27Q96NW4 1050 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 FTHL17Q9BXU8 183 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 CDHR5Q9HBB8 845 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 SORCS3Q9UPU3 1222 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 TPP1O14773 563 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 TSPAN1O60635 241 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 ZCCHC18P0CG32 403 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 ADRA1BP35368 520 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 TUSC3Q13454 348 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 SPRED3Q2MJR0 410 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 UCMAQ8WVF2 138 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 FAM162AQ96A26 154 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 ARMCX1Q9P291 453 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 BANF1O75531 89 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 PIGRP01833 764 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 UNGP13051 313 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 FBXL18Q96ME1 805 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 GMLQ99445 158 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 ADNPQ9H2P0 1102 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 TTLL13PA6NNM8 815 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 C5orf58C9J3I9 102 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 FBXO39Q8N4B4 442 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 TMEM109Q9BVC6 243 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 MAGEA13PA6NCF6 341 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 MYL4P12829 197 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 PPP3CCP48454 512 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 SH3D19Q5HYK7 790 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 ECHDC2Q86YB7 292 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 LZICQ8WZA0 190 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 P2RY11Q96G91 374 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF536O15090 1300 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 MT-CO1P00395 513 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 ARCQ7LC44 396 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 TFAP2BQ92481 460 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 CEP19Q96LK0 163 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 NMRK1Q9NWW6 199 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 CLUHO75153 1309 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 FZD9O00144 591 aa16.33■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 DCXO43602 365 aa16.33■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 PIGNO95427 931 aa16.33■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 NAGLUP54802 743 aa16.33■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 SP3Q02447 781 aa16.33■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 BST1Q10588 318 aa16.33■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 NFYCQ13952 458 aa16.33■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 GALNTL6Q49A17 601 aa16.33■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 BRMS1LQ5PSV4 323 aa16.33■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 CYGBQ8WWM9 190 aa16.33■□□□□ 0.21
C9orf172-201ENST00000436881 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms