RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391058.1

RNU6-1177P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1177, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1177P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MCM3P25205 808 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PPP3CCP48454 512 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 AGTR2P50052 363 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PGDP52209 483 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LIMK2P53671 638 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NOGQ13253 232 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DHCR24Q15392 516 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DCST1Q5T197 706 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CACHD1Q5VU97 1274 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 C14orf37Q86TY3 774 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HPS6Q86YV9 775 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 P3H2Q8IVL5 708 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLC39A11Q8N1S5 342 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLC15A4Q8N697 577 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KLHDC9Q8NEP7 349 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLC24A4Q8NFF2 622 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TRIM58Q8NG06 486 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZNF721Q8TF20 911 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ASB12Q8WXK4 309 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CPT1BQ92523 772 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MKL1Q969V6 931 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 COA7Q96BR5 231 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TTC14Q96N46 770 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TTC1Q99614 292 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TMX1Q9H3N1 280 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KLHL31Q9H511 634 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZSCAN32Q9NX65 697 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 BARHL2Q9NY43 387 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GPR83Q9NYM4 423 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CACNG5Q9UF02 275 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CGNL1Q0VF96 1302 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DYTNA2CJ06 578 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CXorf65A6NEN9 183 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLC16A6O15403 523 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 BCL2L11O43521 198 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RGS10O43665 173 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ITM2AO43736 263 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MARCH6O60337 910 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RASAL1O95294 804 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LCKP06239 509 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 THP07101 528 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLC16A2P36021 539 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 AVPR1AP37288 418 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ADPRHP54922 357 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TMPRSS3P57727 454 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TNFAIP2Q03169 654 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 COX10Q12887 443 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ITGA9Q13797 1035 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CALCRLQ16602 461 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MON1BQ7L1V2 547 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SFR1Q86XK3 245 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NIM1KQ8IY84 436 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLC35F5Q8WV83 523 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZNRF4Q8WWF5 429 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FIG4Q92562 907 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 JADE3Q92613 823 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PKP2Q99959 881 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FGF22Q9HCT0 170 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LMBRD1Q9NUN5 540 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ABCF3Q9NUQ8 709 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PNPOQ9NVS9 261 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ASIC3Q9UHC3 531 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 POMT2Q9UKY4 750 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLC6A5Q9Y345 797 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.38
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TRIM75PA6NK02 468 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZNF587BE7ETH6 402 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PPP6R2O75170 966 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KDM4BO94953 1096 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IGKV3-11P04433 115 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PRSS56P0CW18 603 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MGMTP16455 207 aa0.15□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms