RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPPL3Q8TCT6 385 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 C2CD4CQ8TF44 421 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 AFG1LQ8WV93 481 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 SDCCAG3Q96C92 435 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 HMCESQ96FZ2 354 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 VCPIP1Q96JH7 1222 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 HERPUD2Q9BSE4 406 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 CHODLQ9H9P2 273 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF304Q9HCX3 659 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 Q9N2J8 555 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMLHEQ9NVH6 421 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM248Q9NWD8 314 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 KLQ9UEF7 1012 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 GPR52Q9Y2T5 361 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 C17orf100A8MU93 164 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 TULP3O75386 442 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGKV2-30P06310 120 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 PSG1P11464 419 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARSAP15289 507 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 TYK2P29597 1187 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 PNPLA4P41247 253 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 STAT1P42224 750 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 MCM2P49736 904 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARL4CP56559 192 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 GAD2Q05329 585 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 PMPCAQ10713 525 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 TWIST1Q15672 202 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 ODF3L2Q3SX64 289 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 GXYLT1Q4G148 440 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 ENTPD8Q5MY95 495 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 LRCH2Q5VUJ6 765 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 NUGGCQ68CJ6 796 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 HMBOX1Q6NT76 420 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 GPSM1Q86YR5 675 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 ANKRD42Q8N9B4 389 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 LINS1Q8NG48 757 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 ISCA1Q9BUE6 129 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRIM31Q9BZY9 425 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 ACAD9Q9H845 621 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 THAP1Q9NVV9 213 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC25A13Q9UJS0 675 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 STX16O14662 325 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 SYN3O14994 580 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 IRAK2O43187 625 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 SEPT4O43236 478 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 TOMM40O96008 361 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 LCKP06239 509 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 CYP4B1P13584 511 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 RXRAP19793 462 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 KLRC2P26717 231 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 GSTM2P28161 218 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 CHRNA5P30532 468 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 OAZ1P54368 228 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 PKP1Q13835 747 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADCK5Q3MIX3 580 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF260Q3ZCT1 412 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLK5Q496M5 336 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 MANEAQ5SRI9 462 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 AWAT2Q6E213 333 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 COLCA1Q6ZS62 124 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 RFX8Q6ZV50 586 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 KDELC2Q7Z4H8 507 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 GALNT7Q86SF2 657 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC25Q86WR0 208 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 BRSK2Q8IWQ3 736 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 CEP70Q8NHQ1 597 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM174Q8WUU8 243 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC25A28Q96A46 364 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 MAP6D1Q9H9H5 199 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 DECR2Q9NUI1 292 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 POT1Q9NUX5 634 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 UPB1Q9UBR1 384 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 DERAQ9Y315 318 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A0A0MQY5 61 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP2.8□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 BMP15O95972 392 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 IFNA2P01563 188 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 FCGR2AP12318 317 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC16A2P36021 539 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 CYP2J2P51589 502 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 RPS6KA3P51812 740 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 MVDP53602 400 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 LINC00205P59089 165 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRTAP10-11P60412 298 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRTGQ2VWP7 1150 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 RUNDC3AQ59EK9 446 aa2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.3 ms