RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354833.7

SERF1A-202, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1A, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1A-202ENST00000354833 SPARCL1Q14515 664 aa24.85■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 CCNJLQ8IV13 435 aa24.85■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa24.85■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 FIBCD1Q8N539 461 aa24.85■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 BCAS4Q8TDM0 211 aa24.85■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 USP33Q8TEY7 942 aa24.85■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 RXFP1Q9HBX9 757 aa24.85■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 KCNK9Q9NPC2 374 aa24.85■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 PTPRSQ13332 1948 aa24.84■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 NUP205Q92621 2012 aa24.84■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 TEX28O15482 410 aa24.84■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 MGAT1P26572 445 aa24.84■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 PLD1Q13393 1074 aa24.84■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 PRPSAP1Q14558 356 aa24.84■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 STEAP4Q687X5 459 aa24.84■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 ZBP1Q9H171 429 aa24.84■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 ZNF212Q9UDV6 495 aa24.84■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa24.84■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 INSL5Q9Y5Q6 135 aa24.84■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 TACR2P21452 398 aa24.83■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 PPP3CCP48454 512 aa24.83■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 CYS1Q717R9 158 aa24.83■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 ARNTL2Q8WYA1 636 aa24.83■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 BADQ92934 168 aa24.83■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 NAT9Q9BTE0 207 aa24.83■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 TRABDQ9H4I3 376 aa24.83■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 IKBKGQ9Y6K9 419 aa24.83■■□□□ 1.57
SERF1A-202ENST00000354833 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa24.83■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 CTSAP10619 480 aa24.83■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 HARS2P49590 506 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 EPHB3P54753 998 aa24.83■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 FPGSQ05932 587 aa24.83■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 ZSCAN26Q16670 478 aa24.83■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 ANO4Q32M45 955 aa24.83■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 CASC4Q6P4E1 433 aa24.83■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 OR52K1Q8NGK4 314 aa24.83■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 FATE1Q969F0 183 aa24.83■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 CASS4Q9NQ75 786 aa24.83■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa24.83■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 INSL6Q9Y581 213 aa24.83■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 KIAA1671Q9BY89 1806 aa24.82■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 PSMD3O43242 534 aa24.82■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 ACSL4O60488 711 aa24.82■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 INHBAP08476 426 aa24.82■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 SEC24CP53992 1094 aa24.82■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 CRADDP78560 199 aa24.82■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 C5orf22Q49AR2 442 aa24.82■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 OTOP3Q7RTS5 596 aa24.82■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 MZB1Q8WU39 189 aa24.82■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 PSMG2Q969U7 264 aa24.82■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 PLD4Q96BZ4 506 aa24.82■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 HMCESQ96FZ2 354 aa24.82■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 FCRL5Q96RD9 977 aa24.82■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 RABEP2Q9H5N1 569 aa24.82■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 LRRC40Q9H9A6 602 aa24.82■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 SYBUQ9NX95 663 aa24.82■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 GMNCA6NCL1 334 aa24.81■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 F5H5T6 163 aa24.81■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 PGAM1P18669 254 aa24.81■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 SLC11A2P49281 568 aa24.81■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 OLIG2Q13516 323 aa24.81■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 MPP2Q14168 576 aa24.81■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 SLC26A11Q86WA9 606 aa24.81■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 LRRC6Q86X45 466 aa24.81■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 MYEOVQ96EZ4 313 aa24.81■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 SMC6Q96SB8 1091 aa24.81■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 ZBED2Q9BTP6 218 aa24.81■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 GLOD4Q9HC38 313 aa24.81■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 MOCS1Q9NZB8 636 aa24.81■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 SHROOM3Q8TF72 1996 aa24.81■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 USP12O75317 370 aa24.81■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 OAS1P00973 400 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 EN2P19622 333 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 IFNAR2P48551 515 aa24.81■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 MAPKAPK2P49137 400 aa24.81■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 PPM1NQ8N819 430 aa24.81■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 KIF9Q9HAQ2 790 aa24.81■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa24.8■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 A0A1W2PPM1 405 aa24.8■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 FAM159BA6NKW6 160 aa24.8■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP24.8■■□□□ 1.56
SERF1A-202ENST00000354833 ALDH1A2O94788 518 aa24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms