RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA6L10A6NI86 522 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 YJEFN3A6XGL0 299 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 WASH3PC4AMC7 463 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 E7ENQ6 273 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CER1O95813 267 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 BMP1P13497 986 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MPLP40238 635 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ACTR1BP42025 376 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MAGEA11P43364 429 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ACTR1AP61163 376 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PDCLQ13371 301 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PRRT3Q5FWE3 981 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 FOXR2Q6PJQ5 311 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZVU0 165 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RTL10Q7L3V2 364 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 AHI1Q8N157 1196 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 C3orf58Q8NDZ4 430 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 DNASE1L2Q92874 299 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ASB16Q96NS5 453 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC77Q9BR77 488 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SPTLC3Q9NUV7 552 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 BFARQ9NZS9 450 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MAFFQ9ULX9 164 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 STARD13Q9Y3M8 1113 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MFAP3LO75121 409 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFS3O75489 264 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ECI2O75521 394 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TM7SF2O76062 418 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJB1P25685 340 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ADSSP30520 456 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CASQ1P31415 396 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MAGEA9P43362 315 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SLC6A11P48066 632 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PEX5P50542 639 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PPARDQ03181 441 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 DSC1Q08554 894 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ELP6Q0PNE2 266 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SPIDRQ14159 915 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PDK1Q15118 436 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CFAP221Q4G0U5 840 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CBWD6Q4V339 395 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ARSIQ5FYB1 569 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CBWD3Q5JTY5 395 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MIIPQ5JXC2 388 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 COLEC12Q5KU26 742 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CBWD5Q5RIA9 395 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 USP53Q70EK8 1073 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SLC9A9Q8IVB4 645 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 KLHL7Q8IXQ5 586 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 STK40Q8N2I9 435 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CDC26Q8NHZ8 85 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 FEZF2Q8TBJ5 459 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SLC35C1Q96A29 364 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 KLHL32Q96NJ5 620 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ERGIC2Q96RQ1 377 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 EGFL8Q99944 293 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RXFP1Q9HBX9 757 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CLIC5Q9NZA1 410 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 UBP1Q9NZI7 540 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PIRO00625 290 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PRAMEF12O95522 483 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 GYPCP04921 128 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 EZRP15311 586 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CTPS1P17812 591 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MSH3P20585 1137 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TARSP26639 723 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGAP8P85298 464 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC142Q17RM4 750 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CRTC3Q6UUV7 619 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZS52 159 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TAS1R3Q7RTX0 852 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 LRRTM3Q86VH5 581 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 LONP2Q86WA8 852 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGEF19Q8IW93 802 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RHOT2Q8IXI1 618 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 FUKQ8N0W3 1084 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D19Q8N5T2 526 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 EID2Q8N6I1 236 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 EXT2Q93063 718 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ELSPBP1Q96BH3 223 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CFAP57Q96MR6 1250 aa4.53□□□□□ -1.68
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