RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 DYRK1BQ9Y463 629 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 CLRN2A0PK11 232 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 ACAT2Q9BWD1 397 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 GMIPQ9P107 970 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 TRIM38O00635 465 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 SLC22A2O15244 555 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 HARS2P49590 506 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 ACVR2BQ13705 512 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 MTX3Q5HYI7 312 aa8.36□□□□□ -1.07
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PKHD1-201ENST00000340994 TMEM110Q86TL2 294 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 HIPK1Q86Z02 1210 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 EGFL6Q8IUX8 553 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 FBXO39Q8N4B4 442 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 FAM172AQ8WUF8 416 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 GPRASP2Q96D09 838 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 XKR8Q9H6D3 395 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 SMURF2Q9HAU4 748 aa8.36□□□□□ -1.07
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PKHD1-201ENST00000340994 TRHDEQ9UKU6 1024 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 INVSQ9Y283 1065 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF609O15014 1411 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 FOXN1O15353 648 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 RPN2P04844 631 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 FAM153BP0C7A2 387 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 COX4I1P13073 169 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 HPGDP15428 266 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 PPIBP23284 216 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 HERVK_113P62684 666 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 CCNIQ14094 377 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 YME1L1Q96TA2 773 aa8.36□□□□□ -1.07
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PKHD1-201ENST00000340994 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 SMIM22K7EJ46 135 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 NADKO95544 446 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 MMP13P45452 471 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 KCNJ2P63252 427 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 LIN52Q52LA3 116 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 XKR3Q5GH77 459 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 PPM1LQ5SGD2 360 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 OOSP2Q86WS3 158 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 PPP1R14AQ96A00 147 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 CHST12Q9NRB3 414 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 ITGA11Q9UKX5 1188 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 BICRAQ9NZM4 1560 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 PRKCBP05771 671 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 GRIA3P42263 894 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 RENBPP51606 427 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 PCSK7Q16549 785 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 Q3C1V9 767 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 DDI2Q5TDH0 399 aa8.36□□□□□ -1.07
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PKHD1-201ENST00000340994 MROH2AA6NES4 1674 aa8.36□□□□□ -1.07
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PKHD1-201ENST00000340994 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 PQLC1Q8N2U9 271 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 TPD52L3Q96J77 140 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 VAT1Q99536 393 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 KNL1Q8NG31 2342 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 DLG5Q8TDM6 1919 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 PROSCO94903 275 aa8.35□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 ARPP19P56211 112 aa8.35□□□□□ -1.07
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PKHD1-201ENST00000340994 C15orf40Q8WUR7 153 aa8.35□□□□□ -1.07
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PKHD1-201ENST00000340994 NEDD4LQ96PU5 975 aa8.35□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 APOL2Q9BQE5 337 aa8.35□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa8.35□□□□□ -1.07
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PKHD1-201ENST00000340994 PYHIN1Q6K0P9 492 aa8.35□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 DYNLL2Q96FJ2 89 aa8.35□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 CCSER2Q9H7U1 834 aa8.35□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 ANKEF1Q9NU02 776 aa8.35□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 DNAJB4Q9UDY4 337 aa8.35□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 SLC22A1O15245 554 aa8.35□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 MLYCDO95822 493 aa8.35□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 ST8SIA6P61647 398 aa8.35□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa8.35□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 PRDX6P30041 224 aa8.35□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 CRKLP46109 303 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 BCAT1P54687 386 aa8.35□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 CDC16Q13042 620 aa8.35□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 MFSD5Q6N075 450 aa8.35□□□□□ -1.07
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