RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 DSG1Q02413 1049 aa18.28■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 SLC1A5Q15758 541 aa18.28■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 CES3Q6UWW8 571 aa18.28■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 ANKLE1Q8NAG6 615 aa18.28■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 ARMC5Q96C12 935 aa18.28■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 TMEM169Q96HH4 297 aa18.28■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 IL12RB2Q99665 862 aa18.28■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 ZYG11BQ9C0D3 744 aa18.28■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 CASS4Q9NQ75 786 aa18.28■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
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ACTB-201ENST00000331789 SLC18A1P54219 525 aa18.27■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP18.27■□□□□ 0.525e-7■■■■□ 22.6
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ACTB-201ENST00000331789 SEC16BQ96JE7 1060 aa18.27■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa18.27■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 CYP4F11Q9HBI6 524 aa18.27■□□□□ 0.52
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF180Q9UJW8 692 aa18.27■□□□□ 0.51
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ACTB-201ENST00000331789 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 CACNG3O60359 315 aa18.26■□□□□ 0.51
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ACTB-201ENST00000331789 TPH1P17752 444 aa18.26■□□□□ 0.51
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ACTB-201ENST00000331789 KIAA1671Q9BY89 1806 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
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ACTB-201ENST00000331789 DRGXA6NNA5 263 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 HLA-DQB2P05538 268 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 BMPR2Q13873 1038 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 SH2D5Q6ZV89 423 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 CYS1Q717R9 158 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 CHSY1Q86X52 802 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
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ACTB-201ENST00000331789 CEP295NLQ96MC4 621 aa18.25■□□□□ 0.51
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ACTB-201ENST00000331789 LAG3P18627 525 aa18.25■□□□□ 0.51
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ACTB-201ENST00000331789 NDST2P52849 883 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 TCP10LQ8TDR4 215 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 FCRL5Q96RD9 977 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 NAT9Q9BTE0 207 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 SAMD15Q9P1V8 674 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 FNIP2Q9P278 1114 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 YIPF1Q9Y548 306 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-201ENST00000331789 J3KR12 359 aa18.24■□□□□ 0.51
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