RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 APOL2Q9BQE5 337 aa23.26■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 MOCS1Q9NZB8 636 aa23.26■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa23.25■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 VIMP08670 466 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 CA4P22748 312 aa23.25■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 AUTS2Q8WXX7 1259 aa23.25■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa23.25■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 PGAM1P18669 254 aa23.25■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJB2P25686 324 aa23.25■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 RING1Q06587 406 aa23.25■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 NUGGCQ68CJ6 796 aa23.25■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 DNAAF3Q8N9W5 541 aa23.25■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA22Q8NHS9 363 aa23.25■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 MYEOVQ96EZ4 313 aa23.25■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 SERAC1Q96JX3 654 aa23.25■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 IL12RB2Q99665 862 aa23.25■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa23.25■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 CASS4Q9NQ75 786 aa23.25■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM248Q9NWD8 314 aa23.25■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 TCP11X1B4DZS4 312 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 ALDH1A2O94788 518 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 MT-ND3P03897 115 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 NADSYN1Q6IA69 706 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 CES3Q6UWW8 571 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 OTOP2Q7RTS6 562 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 CEP295NLQ96MC4 621 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF840PA6NDX5 716 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA0355O15063 1070 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 CACNG3O60359 315 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 GJB5O95377 273 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 ASMTLO95671 621 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 LAG3P18627 525 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 SLC18A1P54219 525 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 PRPSAP1Q14558 356 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 CRYMQ14894 314 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 SLC1A5Q15758 541 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 SPG21Q9NZD8 308 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF180Q9UJW8 692 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 YIPF1Q9Y548 306 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 CHSY1Q86X52 802 aa23.23■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 CCNJLQ8IV13 435 aa23.23■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 HMCESQ96FZ2 354 aa23.23■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 SLC17A6Q9P2U8 582 aa23.23■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 DNMT3LQ9UJW3 386 aa23.23■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 NDST2P52849 883 aa23.23■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 TPGS2Q68CL5 300 aa23.23■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 CYS1Q717R9 158 aa23.23■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 BANPQ8N9N5 519 aa23.23■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 YME1L1Q96TA2 773 aa23.23■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 NACA2Q9H009 215 aa23.23■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 GLOD4Q9HC38 313 aa23.23■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa23.23■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 FNIP2Q9P278 1114 aa23.23■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 GRID1Q9ULK0 1009 aa23.23■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 DRGXA6NNA5 263 aa23.22■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM49D1C9J1S8 452 aa23.22■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 HLA-DQB2P05538 268 aa23.22■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 URODP06132 367 aa23.22■■□□□ 1.31
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VSTM4-201ENST00000298454 CERCAMQ5T4B2 595 aa23.22■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 SNX30Q5VWJ9 437 aa23.22■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 NECAB2Q7Z6G3 386 aa23.22■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM199Q8N511 208 aa23.22■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 PDZD8Q8NEN9 1154 aa23.22■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 SEC16BQ96JE7 1060 aa23.22■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 NAT9Q9BTE0 207 aa23.22■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC40Q9H9A6 602 aa23.22■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 BFARQ9NZS9 450 aa23.22■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 SAMD15Q9P1V8 674 aa23.22■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 PRDM4Q9UKN5 801 aa23.22■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa23.22■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 COCHO43405 550 aa23.21■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 TPH1P17752 444 aa23.21■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 ALDH1A3P47895 512 aa23.21■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 IL9RQ01113 521 aa23.21■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 SH2D5Q6ZV89 423 aa23.21■■□□□ 1.31
VSTM4-201ENST00000298454 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
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