RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294623.8

FUBP1-201, Transcript of far upstream element binding protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FUBP1, Length 2,201 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1-201ENST00000294623 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 ZNF781Q8N8C0 355 aa14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 BHMTQ93088 406 aa14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 FEM1CQ96JP0 617 aa14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 IL22Q9GZX6 179 aa14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 ARMC7Q9H6L4 198 aa14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 GGA1Q9UJY5 639 aa14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 TRIM24O15164 1050 aa14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 CFLARO15519 480 aa14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 MED7O43513 233 aa14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 IL1R2P27930 398 aa14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 SFNP31947 248 aa14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 GP5P40197 560 aa14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 CDH15P55291 814 aa14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 BNIP3Q12983 259 aa14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 ITGADQ13349 1161 aa14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 PMS2P3Q13401 168 aa14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 MTX3Q5HYI7 312 aa14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 FGD3Q5JSP0 725 aa14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 FAM102BQ5T8I3 360 aa14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 SLX4IPQ5VYV7 408 aa14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 SLFN12LQ6IEE8 588 aa14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 PRR23CQ6ZRP0 262 aa14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 TANKQ92844 425 aa14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 CPNE1Q99829 537 aa14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 SIPA1L1O43166 1804 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 AQP12BA6NM10 295 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 KCNN4O15554 427 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 SEC14L2O76054 403 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 P4HA1P13674 534 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 HADHAP40939 763 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 GRM1Q13255 1194 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 VPS72Q15906 364 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 TMEM26Q6ZUK4 368 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 CHSY3Q70JA7 882 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 AQP12AQ8IXF9 295 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 SLC45A3Q96JT2 553 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 OR52B2Q96RD2 323 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 DNAI2Q9GZS0 605 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 RAD21L1Q9H4I0 556 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 GPRC5CQ9NQ84 441 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 MORF4L1Q9UBU8 362 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 TCAF1Q9Y4C2 921 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 SNX13Q9Y5W8 968 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 LRRIQ4A6NIV6 560 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 TRPC5OSA6NMA1 111 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 M0QX08 132 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 CFBP00751 764 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 PGAM1P18669 254 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 ARRB2P32121 409 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 PRKCQQ04759 706 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 SEMA5AQ13591 1074 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 GALNT18Q6P9A2 607 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 ZNF773Q6PK81 442 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 HHIPL2Q6UWX4 724 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 HACE1Q8IYU2 909 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 VMP1Q96GC9 406 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 YME1L1Q96TA2 773 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 SLC29A1Q99808 456 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 TMEM216Q9P0N5 145 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 TXNDC16Q9P2K2 825 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa14.49□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 RNF103O00237 685 aa14.48□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 PIGRP01833 764 aa14.48□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 UGT2B4P06133 528 aa14.48□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 APRTP07741 180 aa14.48□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 TYK2P29597 1187 aa14.48□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 DPP6P42658 865 aa14.48□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 TRAF2Q12933 501 aa14.48□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa14.48□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 TMTC4Q5T4D3 741 aa14.48□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 FAM45BPQ6NSW5 357 aa14.48□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 KCTD8Q6ZWB6 473 aa14.48□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 ZNF534Q76KX8 674 aa14.48□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 PTF1AQ7RTS3 328 aa14.48□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa14.48□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.48□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 FAM45AQ8TCE6 357 aa14.48□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 WNK4Q96J92 1243 aa14.48□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 RNF157Q96PX1 679 aa14.48□□□□□ -0.09
FUBP1-201ENST00000294623 FTHL17Q9BXU8 183 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms