RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262903.8

HACE1-201, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HACE1, Length 4,576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-201ENST00000262903 ZNF284Q2VY69 593 aa16.2■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 VSTM1Q6UX27 236 aa16.2■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa16.2■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 CERS2Q96G23 380 aa16.2■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 ACBD6Q9BR61 282 aa16.2■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 CDHR5Q9HBB8 845 aa16.2■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 GMIPQ9P107 970 aa16.2■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 PTPRJQ12913 1337 aa16.2■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 COPAP53621 1224 aa16.2■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 ZNF618Q5T7W0 954 aa16.2■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 CCDC185Q8N715 623 aa16.2■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 STRCP1A6NGW2 1772 aa16.2■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 MYH1P12882 1939 aa16.2■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 MYH6P13533 1939 aa16.2■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 TRIM13O60858 407 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 CTNNB1P35222 781 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 TAPT1Q6NXT6 567 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 EXOC3L1Q86VI1 746 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 CFAP52Q8N1V2 620 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 APBB2Q92870 758 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 RIC8BQ9NVN3 520 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 SRRDQ9UH36 339 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 LTBP4Q8N2S1 1624 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 MOXD2PA6NHM9 499 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 XYLBO75191 536 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 DDHD2O94830 711 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 QPCTQ16769 361 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 PCID2Q5JVF3 399 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 BRMS1LQ5PSV4 323 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 OTOP2Q7RTS6 562 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 STK32AQ8WU08 396 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 DNAJC9Q8WXX5 260 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 SCLYQ96I15 445 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 CENPKQ9BS16 269 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 ACSS3Q9H6R3 686 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 YJEFN3A6XGL0 299 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 E7ENQ6 273 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 MFSD11O43934 449 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 ATP6V1G2O95670 118 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 EDNRBP24530 442 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 BCL2L1Q07817 233 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 PTP4A2Q12974 167 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 FAM187BQ17R55 369 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 MYO1HQ8N1T3 1032 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 SNX3O60493 162 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 PEX5P50542 639 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 NUDT2P50583 147 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 PURAQ00577 322 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 BTKQ06187 659 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 RASA2Q15283 850 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 CACUL1Q86Y37 369 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 RASAL3Q86YV0 1011 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 RAB42Q8N4Z0 105 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 BORCS6Q96GS4 357 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 TMEM237Q96Q45 408 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 FIZ1Q96SL8 496 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 IGFLR1Q9H665 355 aa16.19■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 TULP2O00295 520 aa16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 MPOP05164 745 aa16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 PTPN9P43378 593 aa16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 PLIN5Q00G26 463 aa16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 XRCC4Q13426 336 aa16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 TMEM259Q4ZIN3 620 aa16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 FUT10Q6P4F1 479 aa16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 SPATA17Q96L03 361 aa16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 C16orf70Q9BSU1 422 aa16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 DRD4P21917 467 aa16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 NME5P56597 212 aa16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 CCDC149Q6ZUS6 474 aa16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 TPP1O14773 563 aa16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 SERPINE1P05121 402 aa16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 PBX3P40426 434 aa16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 PPP3CCP48454 512 aa16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 KLC1Q07866 573 aa16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 ARMC12Q5T9G4 340 aa16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 ARHGAP17Q68EM7 881 aa16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 ERLEC1Q96DZ1 483 aa16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 GLI3P10071 1580 aa16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 ABHD2P08910 425 aa16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 NMRAL1Q9HBL8 299 aa16.18■□□□□ 0.18
HACE1-201ENST00000262903 FAM50BQ9Y247 325 aa16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms