RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262288.7

SCPEP1-201, Transcript of serine carboxypeptidase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCPEP1, Length 1,942 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCPEP1-201ENST00000262288 NAB1Q13506 487 aa16.38■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 IKBKEQ14164 716 aa16.38■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 PIK3R6Q5UE93 754 aa16.38■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 KCTD11Q693B1 232 aa16.38■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 FBXO22Q8NEZ5 403 aa16.38■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 C1orf74Q96LT6 269 aa16.38■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 CASS4Q9NQ75 786 aa16.38■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 BFARQ9NZS9 450 aa16.38■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 VANGL2Q9ULK5 521 aa16.38■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 EDF1O60869 148 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 USP12O75317 370 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 PARNO95453 639 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 NIPAL4Q0D2K0 466 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 BMPR2Q13873 1038 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 SPANXN3Q5MJ09 141 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 UNC5BQ8IZJ1 945 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 MICALL1Q8N3F8 863 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 DNAAF3Q8N9W5 541 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 SPATA17Q96L03 361 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 RASSF4Q9H2L5 321 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 LRRC40Q9H9A6 602 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 TMEM39AQ9NV64 488 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 KLHL14Q9P2G3 628 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 PRKAG3Q9UGI9 489 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 TBX21Q9UL17 535 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 MICAL3Q7RTP6 2002 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 SLC38A8A6NNN8 435 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 C2CD2LO14523 706 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 PSMD3O43242 534 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 RFPL1O75677 317 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 EFEMP2O95967 443 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 HMBSP08397 361 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 DHRS4L1P0CG22 281 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 CCNB1P14635 433 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 CCNFP41002 786 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 CNKSR3Q6P9H4 555 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 MIB1Q86YT6 1006 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 CNPY4Q8N129 248 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 FAM111AQ96PZ2 611 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 CLIC5Q9NZA1 410 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa16.37■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 WDR91A4D1P6 747 aa16.36■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 AP3B1O00203 1094 aa16.36■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 ATF6P18850 670 aa16.36■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 OR1D2P34982 312 aa16.36■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 ETV4P43268 484 aa16.36■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 PSEN1P49768 467 aa16.36■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 MGAT5Q09328 741 aa16.36■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 PSMD5Q16401 504 aa16.36■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 USP41Q3LFD5 358 aa16.36■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 C10orf120Q5SQS8 335 aa16.36■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 MROH9Q5TGP6 573 aa16.36■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 FAM117BQ6P1L5 589 aa16.36■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 ZNF449Q6P9G9 518 aa16.36■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 OTOP3Q7RTS5 596 aa16.36■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 CNTD1Q8N815 330 aa16.36■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 CCDC63Q8NA47 563 aa16.36■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 MKS1Q9NXB0 559 aa16.36■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 UBP1Q9NZI7 540 aa16.36■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 GREB1Q4ZG55 1949 aa16.36■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 SLC12A8A0AV02 714 aa16.35■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 MAFKO60675 156 aa16.35■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 NPY2RP49146 381 aa16.35■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 SPRED3Q2MJR0 410 aa16.35■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 MS4A13Q5J8X5 152 aa16.35■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa16.35■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 TIFABQ6ZNK6 161 aa16.35■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 RASSF3Q86WH2 238 aa16.35■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 CHSY1Q86X52 802 aa16.35■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 LRRC49Q8IUZ0 686 aa16.35■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 ZNF683Q8IZ20 524 aa16.35■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 ZNF276Q8N554 614 aa16.35■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 IGSF21Q96ID5 467 aa16.35■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 CCSER2Q9H7U1 834 aa16.35■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 MANSC1Q9H8J5 431 aa16.35■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 ABCF3Q9NUQ8 709 aa16.35■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 COMMD8Q9NX08 183 aa16.35■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 MARCH2Q9P0N8 246 aa16.35■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 FNIP2Q9P278 1114 aa16.35■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 MTRRQ9UBK8 725 aa16.35■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
SCPEP1-201ENST00000262288 CAPN7Q9Y6W3 813 aa16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms