RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 MIOSQ9NXC5 875 aa10.86□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 WDR27A2RRH5 827 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 MGAT1P26572 445 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 FAAP100Q0VG06 881 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 SPANXN3Q5MJ09 141 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 LRRC49Q8IUZ0 686 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 APOPT1Q96IL0 206 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 FAM111AQ96PZ2 611 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 FAM96AQ9H5X1 160 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 CYP4F11Q9HBI6 524 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 PHTF1Q9UMS5 762 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 SLC12A8A0AV02 714 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 MEIS3P2A8K0S8 358 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 PYGBP11216 843 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 HARS2P49590 506 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 ARFIP2P53365 341 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 EPHB1P54762 984 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 CDH17Q12864 832 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 TAZQ16635 292 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 ANKS3Q6ZW76 656 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 LRRN4Q8WUT4 740 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 MCUR1Q96AQ8 359 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 CXCL16Q9H2A7 254 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 PIGVQ9NUD9 493 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 AVILO75366 819 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 HCAR3P49019 387 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 ADGRD1Q6QNK2 874 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 TCP10LQ8TDR4 215 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 VPS39Q96JC1 886 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 SLC2A13Q96QE2 648 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 RABGEF1Q9UJ41 708 aa10.85□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 ENDOD1O94919 500 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 PARNO95453 639 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 TAC4Q86UU9 113 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 SPPL2BQ8TCT7 592 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 MAML1Q92585 1016 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 ADAM28Q9UKQ2 775 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 DOLKQ9UPQ8 538 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 PTPRSQ13332 1948 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 CFAP73A6NFT4 308 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 SLC11A2P49281 568 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 TUFMP49411 452 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 GLUD2P49448 558 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 KCNJ11Q14654 390 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 HFE2Q6ZVN8 426 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 SLC44A1Q8WWI5 657 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 NUDCD1Q96RS6 583 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 CCDC68Q9H2F9 335 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 RGS18Q9NS28 235 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 DCTN4Q9UJW0 460 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 PTPRDP23468 1912 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 NLRC5Q86WI3 1866 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 NRP1O14786 923 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 SEMA5AQ13591 1074 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 RASA2Q15283 850 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 FBXW10Q5XX13 1052 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 SDE2Q6IQ49 451 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 LRRC8BQ6P9F7 803 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 SLC43A3Q8NBI5 491 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 STK38LQ9Y2H1 464 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 A0A1W2PQY0 241 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 F5H5T6 163 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 SH3BP5O60239 455 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 GLRA3O75311 464 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 ALADP13716 330 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 SNCBQ16143 134 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 LMNTD2Q8IXW0 634 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 MIEF2Q96C03 454 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 EPB41L4BQ9H329 900 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 ABCF3Q9NUQ8 709 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 TBC1D13Q9NVG8 400 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 ZFP69BQ9UJL9 534 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 NUDT5Q9UKK9 219 aa10.84□□□□□ -0.67
PRRX1-201ENST00000239461 ALPK3Q96L96 1907 aa10.83□□□□□ -0.68
PRRX1-201ENST00000239461 CEP250Q9BV73 2442 aa10.83□□□□□ -0.68
PRRX1-201ENST00000239461 TIMM44O43615 452 aa10.83□□□□□ -0.68
PRRX1-201ENST00000239461 PMPCBO75439 489 aa10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms