RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 RACGAP1Q9H0H5 632 aa7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 RAB21Q9UL25 225 aa7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 TNFSF13BQ9Y275 285 aa7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 MST1RQ04912 1400 aa7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 RIC1Q4ADV7 1423 aa7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 URADA6NGE7 173 aa7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CASTOR2A6NHX0 329 aa7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SLC15A5A6NIM6 579 aa7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 TEX28O15482 410 aa7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 TYMPP19971 482 aa7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CCNA2P20248 432 aa7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 MGAT1P26572 445 aa7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 RPL9P32969 192 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 STAT5AP42229 794 aa7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SCNN1BP51168 640 aa7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SEC24CP53992 1094 aa7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 MFSD7Q6UXD7 560 aa7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 NEK10Q6ZWH5 1172 aa7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ADHFE1Q8IWW8 467 aa7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 KIAA0895Q8NCT3 520 aa7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ZNF606Q8WXB4 792 aa7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 Q96MT0 163 aa7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 BBS4Q96RK4 519 aa7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 MID1IP1Q9NPA3 183 aa7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ETNK2Q9NVF9 386 aa7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ANGPT4Q9Y264 503 aa7.34□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ATRNO75882 1429 aa7.34□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MROH1Q8NDA8 1641 aa7.34□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SIGLEC16A6NMB1 481 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MRASO14807 208 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 BIRC5O15392 142 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SLITRK3O94933 977 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MED26O95402 600 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ECDO95905 644 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ATP6V1C1P21283 382 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 KLRK1P26718 216 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 HTR7P34969 479 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PRKCIP41743 596 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 GLRBP48167 497 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RPL14P50914 215 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 IL5RAQ01344 420 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 BNIP2Q12982 314 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 NTRK3Q16288 839 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SNX30Q5VWJ9 437 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 IZUMO2Q6UXV1 221 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ZNF605Q86T29 641 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 EPHX4Q8IUS5 362 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SYTL1Q8IYJ3 562 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 FNDC5Q8NAU1 212 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 GDPD5Q8WTR4 605 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 NELL1Q92832 810 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CATSPER2Q96P56 530 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CYP4F12Q9HCS2 524 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TRPC4Q9UBN4 977 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PAICSP22234 425 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ELK3P41970 407 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RTP1P59025 263 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ORC1Q13415 861 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ACVR2BQ13705 512 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 C2CD6Q53TS8 623 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ARCQ7LC44 396 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CROCCP3Q8IVE0 287 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 FIG4Q92562 907 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MKL1Q969V6 931 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 HSFY1Q96LI6 401 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PNMA5Q96PV4 448 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 OSMRQ99650 979 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 DNMT3LQ9UJW3 386 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MYRFQ9Y2G1 1151 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MEI4A8MW99 385 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PEX1O43933 1283 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SEC22BO75396 215 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 STX11O75558 287 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 LTFP02788 710 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 OGNP20774 298 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SPIDRQ14159 915 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SLC30A10Q6XR72 485 aa7.33□□□□□ -1.24
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