RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 MYOCQ99972 504 aa16.99■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 TGFB1I1O43294 461 aa16.98■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 STAT6P42226 847 aa16.98■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 NASPP49321 788 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 INCA1Q0VD86 236 aa16.98■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 NCAPHQ15003 741 aa16.98■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 RFWD3Q6PCD5 774 aa16.98■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa16.98■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 BHLHA9Q7RTU4 235 aa16.98■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 MFN1Q8IWA4 741 aa16.98■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 FIBINQ8TAL6 211 aa16.98■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 CALN1Q9BXU9 219 aa16.98■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 DUSP16Q9BY84 665 aa16.98■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa16.98■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa16.98■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 ANAPC2Q9UJX6 822 aa16.98■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 OTOGQ6ZRI0 2925 aa16.98■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 SLC6A4P31645 630 aa16.97■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 UGT1A5P35504 534 aa16.97■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 CYP2J2P51589 502 aa16.97■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 MANEAQ5SRI9 462 aa16.97■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 XXYLT1Q8NBI6 393 aa16.97■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 NOX5Q96PH1 765 aa16.97■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 PLAAQ9Y263 795 aa16.97■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 KIF20AO95235 890 aa16.96■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 P4HA1P13674 534 aa16.96■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 VAV1P15498 845 aa16.96■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 PRLRP16471 622 aa16.96■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP16.96■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 E2F4Q16254 413 aa16.96■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF542PQ5EBM4 170 aa16.96■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 PITRM1Q5JRX3 1037 aa16.96■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 RAB41Q5JT25 222 aa16.96■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 GCNT7Q6ZNI0 430 aa16.96■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa16.96■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa16.96■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 JAMLQ86YT9 394 aa16.96■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa16.96■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00301Q8NCQ3 95 aa16.96■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 WDR48Q8TAF3 677 aa16.96■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 PANK2Q9BZ23 570 aa16.96■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 PREBQ9HCU5 417 aa16.96■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 FZD3Q9NPG1 666 aa16.96■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 GPR27Q9NS67 375 aa16.96■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 DNAJC28Q9NX36 388 aa16.96■□□□□ 0.31
SPCS1-201ENST00000233025 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa16.96■□□□□ 0.31
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SPCS1-201ENST00000233025 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP16.95■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 SLC31A1O15431 190 aa16.95■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 MSI1O43347 362 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 NME1P15531 152 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 TAS2R38P59533 333 aa16.95■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 CLDN10P78369 228 aa16.95■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 CNTN1Q12860 1018 aa16.95■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 KCNAB2Q13303 367 aa16.95■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 SPIDRQ14159 915 aa16.95■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 ESPL1Q14674 2120 aa16.95■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 SPOPLQ6IQ16 392 aa16.95■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa16.95■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa16.95■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 FBXO39Q8N4B4 442 aa16.95■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 PDILTQ8N807 584 aa16.95■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 MIB2Q96AX9 1013 aa16.95■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 NT5C1AQ9BXI3 368 aa16.95■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 SEPT10Q9P0V9 454 aa16.95■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 SALL4Q9UJQ4 1053 aa16.95■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 TUBD1Q9UJT1 453 aa16.95■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 SARDHQ9UL12 918 aa16.95■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa16.95■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa16.94■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 MUSKO15146 869 aa16.94■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 NVLO15381 856 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 IRAK2O43187 625 aa16.94■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 ASS1P00966 412 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 HGFP14210 728 aa16.94■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 CD97P48960 835 aa16.94■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 STK19P49842 368 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 AP3M2P53677 418 aa16.94■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 POLE2P56282 527 aa16.94■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 ECT2LQ008S8 904 aa16.94■□□□□ 0.3
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