RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 ZFP1Q6P2D0 407 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 BEST2Q8NFU1 509 aa22.59■■□□□ 1.21
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HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF385DQ9H6B1 395 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 RAB26Q9ULW5 256 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 AIM2O14862 343 aa22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 HDAC3O15379 428 aa22.58■■□□□ 1.21
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HTATSF1-201ENST00000218364 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
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HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF423Q2M1K9 1284 aa22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 SNX32Q86XE0 403 aa22.58■■□□□ 1.21
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HTATSF1-201ENST00000218364 Q9H521 79 aa22.58■■□□□ 1.21
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HTATSF1-201ENST00000218364 DCLK1O15075 740 aa22.58■■□□□ 1.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 PTPN3P26045 913 aa22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 GTF2A2P52657 109 aa22.57■■□□□ 1.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 KCTD11Q693B1 232 aa22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 SPATA24Q86W54 205 aa22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 EPAS1Q99814 870 aa22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 MPSTP25325 297 aa22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 LMO2P25791 158 aa22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 RPL14P50914 215 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 ZYG11AQ6WRX3 759 aa22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 TP53INP2Q8IXH6 220 aa22.57■■□□□ 1.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 CHRNGP07510 517 aa22.56■■□□□ 1.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 MPP3Q13368 585 aa22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 HERC3Q15034 1050 aa22.56■■□□□ 1.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 GOLGA8OA6NCC3 632 aa22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 GOLGA8NF8WBI6 632 aa22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNK1O00180 336 aa22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 CREB3O43889 395 aa22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 NOS2P35228 1153 aa22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 HADHAP40939 763 aa22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 THOP1P52888 689 aa22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 Q3C1V9 767 aa22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 PPM1LQ5SGD2 360 aa22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 SEL1L3Q68CR1 1132 aa22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 ADCY4Q8NFM4 1077 aa22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 CDRT15Q96T59 188 aa22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 SETD4Q9NVD3 440 aa22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 PLK2Q9NYY3 685 aa22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 UBAP1Q9NZ09 502 aa22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 RAD54BQ9Y620 910 aa22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 GRID2O43424 1007 aa22.55■■□□□ 1.2
HTATSF1-201ENST00000218364 USP12O75317 370 aa22.55■■□□□ 1.2
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