RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdo1P60334 200 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bpifa6Q0VGU8 367 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mif4gdQ3UBZ5 222 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Itih3Q61704 889 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sema3cQ62181 751 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tfdp2Q64163 446 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psd2Q6P1I6 770 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zdhhc17Q80TN5 632 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Armc12Q80X86 340 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrc19Q8BZT5 364 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prr33Q8C494 260 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ugt2b1Q8R084 529 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dync1li1Q8R1Q8 523 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Otud7aQ8R554 926 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GatmQ9D964 423 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmco5aQ9D9D5 303 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r65Q9EPS7 332 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lima1Q9ERG0 753 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pdpk1Q9Z2A0 559 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm8113E0CXS8 587 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DgkdE9PUQ8 1220 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1022L7MTT3 315 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Anxa5P48036 319 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ranbp9P69566 653 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stt3bQ3TDQ1 823 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrgprx2Q3UG50 352 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Parp3Q3ULW8 533 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Als2clQ60I26 952 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cnksr3Q8BMA3 555 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zbtb6Q8K088 423 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrps2Q924T2 291 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kif12Q9D2Z8 642 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krt20Q9D312 431 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Oma1Q9D8H7 521 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dclre1aQ9JIC3 1026 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ripk3Q9QZL0 486 aa12.93□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm1141B9EJU1 475 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pate1E9Q658 125 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5689F6Y2A6 97 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp105G3X9I0 524 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klf6O08584 283 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptpn9O35239 593 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ItgalP24063 1163 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 S100bP50114 92 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lypla1P97823 230 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trcg1Q58Y74 825 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Msi1Q61474 362 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gdpd5Q640M6 607 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mvb12bQ6KAU4 317 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DstykQ6XUX1 927 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tas2r102Q7M717 329 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1057Q7TR75 315 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ube2q1Q7TSS2 422 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TdrkhQ80VL1 560 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q8BGA7 448 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxw8Q8BIA4 598 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BoraQ8BS90 525 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim61Q8JZK6 461 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpl17Q9CPR4 184 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem59Q9QY73 323 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Epm2aQ9WUA5 330 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpl9-ps1S4R1R7 191 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpinb3cA2RSF9 386 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zbed6D2EAC2 980 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kifc5bE9PUA5 672 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grpel2O88396 224 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vti1aO89116 217 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01652 108 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ArvcfP98203 962 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rcsd1Q3UZA1 412 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AcdQ5EE38 416 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxw2Q60584 422 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SnrpaQ62189 287 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cand1Q6ZQ38 1230 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam107aQ78TU8 144 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr412Q7TRW7 312 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ephb1Q8CBF3 984 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atg14Q8CDJ3 492 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q8CIL4 281 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Irak3Q8K4B2 609 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spats2lQ91WJ7 558 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pip4k2cQ91XU3 421 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pacsin3Q99JB8 424 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sytl2Q99N50 950 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LactbQ9EP89 551 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fgf22Q9ESS2 162 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prl2a1Q9JHK0 228 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DgkeQ9R1C6 564 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rtl9Q32KG4 1339 aa12.92□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ankfn1A0A140LIW7 1083 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sh3pxd2bA2AAY5 908 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp2a22B2RXZ2 492 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ism2D3Z6A3 493 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mroh5E9PUJ8 762 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp2j6O54750 501 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Enpp1P06802 906 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CtswP56203 371 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il1rapl1P59823 695 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 B3gntl1Q3U129 357 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Itga3Q62470 1053 aa12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.5 ms