RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000022507.12

Pspc1-201, Transcript of Paraspeckle component 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pspc1, Length 4,114 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Haus4Q8BFT2 363 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Ubash3bQ8BGG7 638 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Best2Q8BGM5 508 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Pik3cbQ8BTI9 1064 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Senp7Q8BUH8 1037 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Cops7bQ8BV13 264 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Pgm5Q8BZF8 567 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Ccdc90bQ8C3X2 256 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Galnt6Q8C7U7 622 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Mill2Q8HWE5 355 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Dqx1Q924H9 718 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Tinagl1Q99JR5 466 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Nme5Q99MH5 211 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 MrrfQ9D6S7 262 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Ap1s2Q9DB50 160 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Rsc1a1Q9ER99 582 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Dcun1d1Q9QZ73 259 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Zfp846G3X996 541 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Lamp1P11438 406 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 ArsbP50429 534 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Kpna2P52293 529 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Polr2gP62488 172 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Taf1bP97358 586 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 4930480E11RikQ0VG34 394 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Kmt5aQ2YDW7 349 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Plk4Q64702 925 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Rusc1Q8BG26 893 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Dlk2Q8K1E3 382 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 L2hgdhQ91YP0 464 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Gmpr2Q99L27 348 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Ints12Q9D168 461 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 AacsQ9D2R0 672 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 DstnQ9R0P5 165 aa11.64□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Myh13B1AR69 1938 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Grcc10O35127 126 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Trdmt1O55055 415 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Aff1O88573 1216 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 IduaP48441 634 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Rack1P68040 317 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Ebf1Q07802 591 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Neurl1bQ0MW30 546 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Trim71Q1PSW8 855 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Slc16a10Q3U9N9 512 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Repin1Q5U4E2 545 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 EnkurQ6SP97 255 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Trnp1Q80ZI1 223 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Cabcoco1Q8CDT7 208 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Kbtbd4Q8R179 534 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Cyp2c70Q91W64 489 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 D6Wsu163eQ91YN0 552 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Txndc12Q9CQU0 170 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Wwp2Q9DBH0 870 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Slc29a1Q9JIM1 460 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Dnajb1Q9QYJ3 340 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 MlxO08609 298 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Mt-CybP00158 381 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Eif2b4Q61749 524 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Usp49Q6P9L4 685 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Herc4Q6PAV2 1057 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Sarm1Q6PDS3 724 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 SugctQ7TNE1 436 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Olfr832Q7TRG9 312 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Spata7Q80VP2 582 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Tor4aQ8BH02 426 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Pxylp1Q8BHA9 480 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Slc44a2Q8BY89 706 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Acat2Q8CAY6 397 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Rsad2Q8CBB9 362 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Ces2aQ8QZR3 558 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Trim31Q8R0K2 507 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Tti1Q91V83 1085 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Cdca5Q9CPY3 264 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Znf687Q9D2D7 1237 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Cyp4v2Q9DBW0 525 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Il21rQ9JHX3 529 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Gys1Q9Z1E4 738 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Zscan4-ps1A0A1C7CYV3 506 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Zscan4dA7KBS4 506 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Gm8267E9Q207 261 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Rnpepl1G5E872 720 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Gm13128L7MU96 475 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Hmox2O70252 315 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Cd36Q08857 472 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Zscan4fQ3URS2 506 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Srbd1Q497V5 1015 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Q6DFW0 481 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Tmed3Q78IS1 221 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Zscan4cQ80VJ6 506 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Q80Y39 304 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Btbd9Q8C726 612 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Olfr449Q8VGW8 311 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Pqbp1Q91VJ5 263 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Atp5f1Q9CQQ7 256 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Upf1Q9EPU0 1124 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Eif2ak1Q9Z2R9 619 aa11.63□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Cyp4a29A0A087WPC3 509 aa11.62□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Slc43a3A2AVZ9 502 aa11.62□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Apol6B7ZC55 329 aa11.62□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Vmn2r72D3Z4N8 856 aa11.62□□□□□ -0.55
Pspc1-201ENSMUST00000022507 ArP19091 899 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.9 ms