RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cdkn3Q810P3 211 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Smarcal1Q8BJL0 910 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mkl1Q8K4J6 964 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr866Q8VFI7 312 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Golm1Q91XA2 393 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 NamptQ99KQ4 491 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ergic3Q9CQE7 383 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Psmd9Q9CR00 222 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tma16Q9CR02 221 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Polr3hQ9D2C6 204 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ptk2bQ9QVP9 1009 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ripk3Q9QZL0 486 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cib1Q9Z0F4 191 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gipc1Q9Z0G0 333 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fbrsl1E9Q9T0 1031 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ass1P16460 412 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Morf4l1P60762 362 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Psmb4P99026 264 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pdcd4Q61823 469 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sp140Q6NSQ5 534 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rpl10Q6ZWV3 214 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mrgprb8Q7TN51 330 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Znf12Q7TSI0 686 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mical2Q8BML1 960 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 HnmtQ91VF2 295 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pcdhga11Q91XY8 933 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 HlcsQ920N2 722 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dus2Q9D7B1 493 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 GmprQ9DCZ1 345 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Smpd3Q9JJY3 655 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trpc7Q9WVC5 862 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Megf6Q80V70 1572 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm28168A0A087WNP1 180 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Exoc7O35250 697 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Emp3O35912 163 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyp2b19O55071 492 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Syngr1O55100 234 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 IapP03975 557 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dnmt3cP0DOY1 709 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SftpdP50404 374 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nek10Q3UGM2 1111 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 GcgrQ61606 485 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Itih2Q61703 946 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rbl1Q64701 1063 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Paqr6Q6TCG5 343 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trim17Q7TPM3 477 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fbxo28Q8BIG4 368 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fzd10Q8BKG4 582 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gprasp2Q8BUY8 826 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Galnt5Q8C102 930 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Wdr27Q8C5V5 780 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Strip2Q8C9H6 844 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Col23a1Q8K4G2 532 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Map4k3Q99JP0 894 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem9Q9CR23 183 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PacrglQ9D3X5 248 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gid8Q9D7M1 228 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Clca1Q9D7Z6 913 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pgam1Q9DBJ1 254 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc22a4Q9Z306 553 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ms4a14A0A087WSD2 1232 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm5689F6Y2A6 97 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 F830016B08RikG3UWE2 416 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trim15G3UY57 292 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm4758L7N258 96 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 EpoP07321 192 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 En2P09066 324 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ncam1P13595 1115 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ido1P28776 407 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Msr1P30204 458 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Casp7P97864 303 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Faf2Q3TDN2 445 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Papss1Q60967 624 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dync1li2Q6PDL0 492 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Bend6Q6PFX2 281 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem121Q80XA0 318 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cndp1Q8BUG2 492 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trappc12Q8K2L8 797 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tspan8Q8R3G9 235 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Atp5c1Q91VR2 298 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rgs3Q9DC04 966 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rbp7Q9EPC5 134 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Stx12Q9ER00 274 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cacna1fQ9JIS7 1985 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 9330159F19RikD3Z623 648 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ccdc85cE9Q6B2 420 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Serpinb9eO08806 377 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Socs2O35717 198 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Krt1P04104 637 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Scd1P13516 355 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Krt6aP50446 553 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Psme3P61290 254 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lrch2Q3UMG5 773 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sema5bQ60519 1093 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MogQ61885 246 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rab3ipQ68EF0 428 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Atg4cQ811C2 458 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Disc1Q811T9 852 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem198Q8BG75 360 aa10.12□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam210aQ8BGY7 273 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18 ms