RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 TCEAL4Q96EI5 215 aa20.5■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 SERPINB11Q96P15 392 aa20.5■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 GCNAQ96QF7 691 aa20.5■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 APOL5Q9BWW9 433 aa20.5■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 CALN1Q9BXU9 219 aa20.5■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 NACA2Q9H009 215 aa20.5■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 RNF38Q9H0F5 515 aa20.5■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 TRPC7Q9HCX4 862 aa20.5■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 MARCH2Q9P0N8 246 aa20.5■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 SMAPO00193 183 aa20.5■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 MCF2LO15068 1137 aa20.5■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 OAS1P00973 400 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 POU2F2P09086 479 aa20.5■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 GDF10P55107 478 aa20.5■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 LRRC14Q15048 493 aa20.5■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 HIF1AQ16665 826 aa20.5■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa20.5■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 CCDC185Q8N715 623 aa20.5■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 ANKRD42Q8N9B4 389 aa20.5■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 RNF34Q969K3 372 aa20.5■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 CYP2S1Q96SQ9 504 aa20.5■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 VPS37BQ9H9H4 285 aa20.5■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa20.5■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 FOXO6A8MYZ6 492 aa20.49■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 CXCR3P49682 368 aa20.49■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 TUBP50607 506 aa20.49■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 SLC5A9Q2M3M2 681 aa20.49■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 ANKRD54Q6NXT1 300 aa20.49■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 TAX1BP1Q86VP1 789 aa20.49■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 SHKBP1Q8TBC3 707 aa20.49■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 CKAP2Q8WWK9 683 aa20.49■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 MAML1Q92585 1016 aa20.49■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 KDM4CQ9H3R0 1056 aa20.49■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 WDCPQ9H6R7 721 aa20.49■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa20.49■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 DNMT3LQ9UJW3 386 aa20.49■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 BRWD1Q9NSI6 2320 aa20.49■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 HELZP42694 1942 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 SLC12A8A0AV02 714 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 RASA4BC9J798 803 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 H0YHG0 523 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 RASA4O43374 803 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 MOSPD3O75425 235 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 PAPLNO95428 1278 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 SRGAP2BP0DMP2 458 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 GCAP28676 217 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 RPL22P35268 128 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 ARL4CP56559 192 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 STXBP5Q5T5C0 1151 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 MAB21L3Q8N8X9 362 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 NAT8LQ8N9F0 302 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 LEMD2Q8NC56 503 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 CPT1BQ92523 772 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 CCT6BQ92526 530 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 SLC22A12Q96S37 553 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 MAGEB5Q9BZ81 275 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 TLR6Q9Y2C9 796 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 FGF19O95750 216 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 HMBSP08397 361 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 CDH6P55285 790 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 TBX4P57082 545 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 TFDP2Q14188 446 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 BOLA3Q53S33 107 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 KLHDC10Q6PID8 442 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 SYCE2Q6PIF2 218 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 EP400NLQ6ZTU2 488 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 CNPY4Q8N129 248 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 C10orf88Q9H8K7 445 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 ANLNQ9NQW6 1124 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 C5orf42Q9H799 3197 aa20.47■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 TCP11X1B4DZS4 312 aa20.47■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 HDCP19113 662 aa20.47■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 PHBP35232 272 aa20.47■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 MPP2Q14168 576 aa20.47■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 RASA2Q15283 850 aa20.47■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 TEAD2Q15562 447 aa20.47■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 PRSS36Q5K4E3 855 aa20.47■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 TRABD2AQ86V40 505 aa20.47■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 UNC45BQ8IWX7 931 aa20.47■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 TKTL2Q9H0I9 626 aa20.47■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 CLDND1Q9NY35 253 aa20.47■□□□□ 0.87
CLN8-208ENST00000635751 SENP1Q9P0U3 644 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms