RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 ACAD10Q6JQN1 1059 aa25.02■■□□□ 1.6
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CAPNS1-216ENST00000628306 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-216ENST00000628306 TFR2Q9UP52 801 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa25.02■■□□□ 1.6
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CAPNS1-216ENST00000628306 CILPO75339 1184 aa25.01■■□□□ 1.59
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF234Q14588 700 aa25.01■■□□□ 1.59
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CAPNS1-216ENST00000628306 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa25.01■■□□□ 1.59
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CAPNS1-216ENST00000628306 MACROD2A1Z1Q3 448 aa25■■□□□ 1.59
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CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
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CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF510Q9Y2H8 683 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-216ENST00000628306 MTA2O94776 668 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-216ENST00000628306 HMBSP08397 361 aa24.98■■□□□ 1.59
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CAPNS1-216ENST00000628306 COL28A1Q2UY09 1125 aa24.98■■□□□ 1.59
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CAPNS1-216ENST00000628306 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
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CAPNS1-216ENST00000628306 CDC23Q9UJX2 597 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-216ENST00000628306 BTBD3Q9Y2F9 522 aa24.96■■□□□ 1.59
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CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1B0GVT2 93 aa24.95■■□□□ 1.59
CAPNS1-216ENST00000628306 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
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CAPNS1-216ENST00000628306 MATKP42679 507 aa24.95■■□□□ 1.59
CAPNS1-216ENST00000628306 RAD23BP54727 409 aa24.95■■□□□ 1.59
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
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