RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609525.1

CSNK2A1-208, Transcript of casein kinase 2 alpha 1, human

TSL 5

Gene CSNK2A1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TWIST1	Q15672	202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LONRF3	Q496Y0	759 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ALS2CL	Q60I27	953 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ICE2	Q659A1	982 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RGMB	Q6NW40	437 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CERS3	Q8IU89	383 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GPC2	Q8N158	579 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C3orf20	Q8ND61	904 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KAT5	Q92993	513 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	VPS33B	Q9H267	617 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	THAP9	Q9H5L6	903 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM51	Q9NW97	253 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CSNK2A1-208	ENST00000609525		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BICDL2	A1A5D9	508 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCDC154	A6NI56	674 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525		H7C1Q1	480 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PDE8B	O95263	885 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ATP1A3	P13637	1013 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC5A1	P13866	664 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CAPN2	P17655	700 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EDNRB	P24530	442 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AMPD3	Q01432	767 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TCF15	Q12870	199 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CUL4B	Q13620	913 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	WTAP	Q15007	396 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ACAP2	Q15057	778 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SRL	Q86TD4	932 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PDILT	Q8N807	584 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	JDP2	Q8WYK2	163 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	JADE3	Q92613	823 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ESR2	Q92731	530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AK8	Q96MA6	479 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NAPB	Q9H115	298 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LY9	Q9HBG7	655 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MYO6	Q9UM54	1294 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MYO1C	O00159	1063 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CES2	O00748	559 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	USP1	O94782	785 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OAZ2	O95190	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RARB	P10826	455 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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