RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STRA8Q7Z7C7 330 aa12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DCLK2Q8N568 766 aa12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TEX9Q8N6V9 391 aa12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMC1BQ8NDV3 1235 aa12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DTX3LQ8TDB6 740 aa12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 APBB2Q92870 758 aa12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC38A7Q9NVC3 462 aa12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PNPOQ9NVS9 261 aa12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSC2P49815 1807 aa12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BIRC5O15392 142 aa12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MGEA5O60502 916 aa12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FBXO21O94952 628 aa12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AP2A1O95782 977 aa12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ITGB1P05556 798 aa12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CNTFP26441 200 aa12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC1A6P48664 564 aa12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRT72Q14CN4 511 aa12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UPP1Q16831 310 aa12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FSTL4Q6MZW2 842 aa12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TAC4Q86UU9 113 aa12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LRRTM3Q86VH5 581 aa12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC9A7Q96T83 725 aa12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SNX15Q9NRS6 342 aa12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BFARQ9NZS9 450 aa12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SCN4AP35499 1836 aa12.07□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRT36O76013 467 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SAT1P21673 171 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CD52P31358 61 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GP5P40197 560 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GARSP41250 739 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IRF9Q00978 393 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ITGA9Q13797 1035 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NAA25Q14CX7 972 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WASHC2DQ5SRD0 308 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRIM68Q6AZZ1 485 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RSPH3Q86UC2 560 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPNS2Q8IVW8 549 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPATA22Q8NHS9 363 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SHKBP1Q8TBC3 707 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATP2A3Q93084 1043 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NTAN1Q96AB6 310 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSPAN18Q96SJ8 248 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WWP1Q9H0M0 922 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GLRA3O75311 464 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PROCP04070 461 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PGM1P36871 562 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SCAPQ12770 1279 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARL13BQ3SXY8 428 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KDELC2Q7Z4H8 507 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AGR3Q8TD06 166 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMARCD1Q96GM5 515 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CXorf56Q9H5V9 222 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LRRC40Q9H9A6 602 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRPV2Q9Y5S1 764 aa12.06□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARHGAP42A6NI28 874 aa12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MEI4A8MW99 385 aa12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DFFAO00273 331 aa12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NMBRP28336 390 aa12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RGS2P41220 211 aa12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCTD11Q693B1 232 aa12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAVSQ7Z434 540 aa12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM135Q86UB9 458 aa12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCNJLQ8IV13 435 aa12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM86AQ8N2M4 240 aa12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 POU5F2Q8N7G0 328 aa12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CNTD1Q8N815 330 aa12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR10T2Q8NGX3 314 aa12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM167BQ9BTA0 163 aa12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NAT9Q9BTE0 207 aa12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TUBB6Q9BUF5 446 aa12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COPG2Q9UBF2 871 aa12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DCDC2Q9UHG0 476 aa12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDH9Q9ULB4 789 aa12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MSI1O43347 362 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AKR1A1P14550 325 aa12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 THPOP40225 353 aa12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CXCR3P49682 368 aa12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RCN1Q15293 331 aa12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TAF11Q15544 211 aa12.05□□□□□ -0.48
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPANXN3Q5MJ09 141 aa12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms