RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600393.1

FCHO1-233, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 4

Gene FCHO1, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-233	ENST00000600393	PPP2CA	P67775	309 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	CDK17	Q00537	523 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	NME3	Q13232	169 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	TEAD4	Q15561	434 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	CCDC157	Q569K6	752 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	FBXL22	Q6P050	247 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	BEND5	Q7L4P6	421 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	C14orf80	Q86SX3	495 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	PTPRN2	Q92932	1015 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	RNF34	Q969K3	372 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	SGK2	Q9HBY8	427 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		13.3	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393		I6L893	689 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	TAF4	O00268	1085 aa		13.29	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	DAB1	O75553	588 aa		13.29	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	MOCS3	O95396	460 aa		13.29	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF883	P0CG24	379 aa		13.29	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	CTSK	P43235	329 aa		13.29	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	SCAP	Q12770	1279 aa		13.29	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	C2CD6	Q53TS8	623 aa		13.29	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		13.29	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	USP30	Q70CQ3	517 aa		13.29	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		13.29	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		13.29	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	OMD	Q99983	421 aa		13.29	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		13.29	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	SARDH	Q9UL12	918 aa		13.29	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		13.29	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		13.29	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393		A0A1B0GVM2	712 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393		A0A1W2PPC4	97 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	CBX4	O00257	560 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	FLRT2	O43155	660 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	HSF2BP	O75031	334 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	RTN2	O75298	545 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	PAGE1	O75459	146 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	CNTN5	O94779	1100 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	IL1B	P01584	269 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	ABCB4	P21439	1286 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	CCR1	P32246	355 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	CCT8	P50990	548 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	ADPRH	P54922	357 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	CLDN6	P56747	220 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	ARID5B	Q14865	1188 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	MIIP	Q5JXC2	388 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	TAF3	Q5VWG9	929 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393		Q6ZVU0	165 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	GLRX5	Q86SX6	157 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	FRS2	Q8WU20	508 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	ALG14	Q96F25	216 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	SIK2	Q9H0K1	926 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	SYNC	Q9H7C4	482 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	PIGV	Q9NUD9	493 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	LHX6	Q9UPM6	363 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		13.28	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
FCHO1-233	ENST00000600393	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
FCHO1-233	ENST00000600393	FAM149A	A5PLN7	773 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FCHO1-233	ENST00000600393	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FCHO1-233	ENST00000600393		M0QYT0	321 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FCHO1-233	ENST00000600393	BNIP3L	O60238	219 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FCHO1-233	ENST00000600393	ADCY5	O95622	1261 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FCHO1-233	ENST00000600393	CAPNS1	P04632	268 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FCHO1-233	ENST00000600393	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
FCHO1-233	ENST00000600393	DRD3	P35462	400 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FCHO1-233	ENST00000600393	C21orf59	P57076	290 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FCHO1-233	ENST00000600393	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29

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