RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, human

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRD4-208	ENST00000597315	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
BRD4-208	ENST00000597315	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
BRD4-208	ENST00000597315	DEFB119	Q8N690	84 aa		27.71	■■■□□ 2.03
BRD4-208	ENST00000597315	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
BRD4-208	ENST00000597315	PARVA	Q9NVD7	372 aa		27.71	■■■□□ 2.03
BRD4-208	ENST00000597315	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
BRD4-208	ENST00000597315	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		27.7	■■■□□ 2.03
BRD4-208	ENST00000597315	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		27.7	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	SKIL	P12757	684 aa		27.7	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	RRM1	P23921	792 aa		27.7	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	ADRA1B	P35368	520 aa		27.7	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	IRAK1	P51617	712 aa		27.7	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	KRT83	P78385	493 aa		27.7	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	NFKBIB	Q15653	356 aa		27.7	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		27.7	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		27.7	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		27.7	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		27.7	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	SYT11	Q9BT88	431 aa		27.7	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		27.7	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		27.7	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	MPP6	Q9NZW5	540 aa		27.7	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		27.7	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	27.7	■■■□□ 2.02	8e-9	■□□□□ 9
BRD4-208	ENST00000597315	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	DRGX	A6NNA5	263 aa		27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315		I6L893	689 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	CNTN5	O94779	1100 aa		27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	GZMA	P12544	262 aa		27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	OR1E1	P30953	314 aa		27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	PBX1	P40424	430 aa		27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	PTGER3	P43115	390 aa		27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	TPMT	P51580	245 aa		27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	ZBED6	P86452	979 aa		27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	ZBTB16	Q05516	673 aa		27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	ALF	Q53S48	1182 aa		27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	NETO1	Q8TDF5	533 aa		27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	FOXJ1	Q92949	421 aa		27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	CFAP54	Q96N23	3096 aa		27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		27.69	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	CKAP5	Q14008	2032 aa		27.68	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	TTC34	A8MYJ7	566 aa		27.68	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	RTN2	O75298	545 aa		27.68	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF33A	Q06730	810 aa		27.68	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	ACCSL	Q4AC99	568 aa		27.68	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		27.68	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	SYT12	Q8IV01	421 aa		27.68	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	TRIM11	Q96F44	468 aa		27.68	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	MYO19	Q96H55	970 aa		27.68	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	CNPY3	Q9BT09	278 aa		27.68	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	CD93	Q9NPY3	652 aa		27.68	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		27.68	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		27.68	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		27.67	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	SIN3B	O75182	1162 aa		27.67	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	HDAC4	P56524	1084 aa		27.67	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	27.67	■■■□□ 2.02	1e-10	■□□□□ 9.5
BRD4-208	ENST00000597315	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		27.67	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	FAM124A	Q86V42	546 aa		27.67	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		27.67	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		27.67	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	GANC	Q8TET4	914 aa		27.67	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	RMDN1	Q96DB5	314 aa		27.67	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		27.67	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	GPR174	Q9BXC1	333 aa		27.67	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		27.67	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	MTG2	Q9H4K7	406 aa		27.67	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		27.67	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		27.67	■■■□□ 2.02
BRD4-208	ENST00000597315	MEI4	A8MW99	385 aa		27.66	■■■□□ 2.02

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