RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 DDIT4Q9NX09 232 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 DUSP10Q9Y6W6 482 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 OPHN1O60890 802 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 HOXD12P35452 270 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 PCK1P35558 622 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 DEUP1Q05D60 604 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 REXO1L1PQ8IX06 675 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEFF1Q8IYR6 380 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 SYCE1Q8N0S2 351 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 KIAA1524Q8TCG1 905 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM172AQ8WUF8 416 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM7Q9C029 511 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF38Q9H0F5 515 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 LZTFL1Q9NQ48 299 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 GUCA1BQ9UMX6 200 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 MACROD2A1Z1Q3 448 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 TBX18O95935 607 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 P2RY2P41231 377 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 TBX4P57082 545 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP11AP98196 1134 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 CRY1Q16526 586 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 BRMS1LQ5PSV4 323 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 NUGGCQ68CJ6 796 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 ARMCX6Q7L4S7 300 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 SPACA7Q96KW9 195 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 ALS2CR12Q96Q35 445 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
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CAPNS1-214ENST00000592483 SALL4Q9UJQ4 1053 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 PILRBQ9UKJ0 227 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 NUDT5Q9UKK9 219 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 MMP17Q9ULZ9 603 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC6A14Q9UN76 642 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 RAXQ9Y2V3 346 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 URB1O60287 2271 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC12A8A0AV02 714 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 BUB1O43683 1085 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 ALDH1A2O94788 518 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 IGLV3-27P01718 113 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 CFIP05156 583 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 CCR1P32246 355 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 CXCR3P49682 368 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 AIF1P55008 147 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 C19orf57Q0VDD7 668 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 MESDQ14696 234 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-214ENST00000592483 C2orf27AQ580R0 203 aa24.4■■□□□ 1.5
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CAPNS1-214ENST00000592483 UNC45BQ8IWX7 931 aa24.4■■□□□ 1.5
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CAPNS1-214ENST00000592483 ATP2A3Q93084 1043 aa24.4■■□□□ 1.5
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CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM10Q9UDY6 481 aa24.4■■□□□ 1.5
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CAPNS1-214ENST00000592483 LATS1O95835 1130 aa24.39■■□□□ 1.49
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CAPNS1-214ENST00000592483 CD59P13987 128 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 HDAC4P56524 1084 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
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CAPNS1-214ENST00000592483 LYSMD4Q5XG99 296 aa24.39■■□□□ 1.49
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CAPNS1-214ENST00000592483 RLN3Q8WXF3 142 aa24.39■■□□□ 1.49
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CAPNS1-214ENST00000592483 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa24.39■■□□□ 1.49
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CAPNS1-214ENST00000592483 AZIN2Q96A70 460 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 PIGVQ9NUD9 493 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-214ENST00000592483 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
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