RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 CORO1BQ9BR76 489 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 CALN1Q9BXU9 219 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 TKTL2Q9H0I9 626 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 TSPYL1Q9H0U9 437 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 ATXN3LQ9H3M9 355 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM30AQ9NV96 361 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
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SMAD4-210ENST00000590061 OR12D3Q9UGF7 316 aa7.56□□□□□ -1.2
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SMAD4-210ENST00000590061 FZD10Q9ULW2 581 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 TFR2Q9UP52 801 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 AP4E1Q9UPM8 1137 aa7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa7.56□□□□□ -1.2
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SMAD4-210ENST00000590061 GREB1Q4ZG55 1949 aa7.56□□□□□ -1.2
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SMAD4-210ENST00000590061 F5H5T6 163 aa7.55□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa7.55□□□□□ -1.2
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SMAD4-210ENST00000590061 TPI1P60174 286 aa7.55□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 OGDHQ02218 1023 aa7.55□□□□□ -1.2
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SMAD4-210ENST00000590061 PDK1Q15118 436 aa7.55□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 SYPL2Q5VXT5 272 aa7.55□□□□□ -1.2
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SMAD4-210ENST00000590061 ZNF783Q6ZMS7 281 aa7.55□□□□□ -1.2
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SMAD4-210ENST00000590061 MCF2LO15068 1137 aa7.54□□□□□ -1.2
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SMAD4-210ENST00000590061 COCHO43405 550 aa7.54□□□□□ -1.2
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SMAD4-210ENST00000590061 SPATA31D3P0C874 917 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 PYGMP11217 842 aa7.54□□□□□ -1.2
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SMAD4-210ENST00000590061 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
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SMAD4-210ENST00000590061 ADAM15Q13444 863 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 CCDC142Q17RM4 750 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 SDHAF4Q5VUM1 108 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 ANKRD54Q6NXT1 300 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa7.54□□□□□ -1.2
SMAD4-210ENST00000590061 HTR3DQ70Z44 454 aa7.54□□□□□ -1.2
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