RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570139.1

CNOT1-222, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 1, human

TSL 2

Gene CNOT1, Length 458 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT1-222	ENST00000570139	TOMM70	O94826	608 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNOT1-222	ENST00000570139	HAUS5	O94927	633 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNOT1-222	ENST00000570139	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
CNOT1-222	ENST00000570139	SBK3	P0C264	359 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNOT1-222	ENST00000570139	NPPB	P16860	134 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNOT1-222	ENST00000570139	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
CNOT1-222	ENST00000570139	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
CNOT1-222	ENST00000570139	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
CNOT1-222	ENST00000570139	UCP3	P55916	312 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNOT1-222	ENST00000570139	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNOT1-222	ENST00000570139	MAPK7	Q13164	816 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNOT1-222	ENST00000570139	GAGE13	Q4V321	117 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
CNOT1-222	ENST00000570139	SPATA1	Q5VX52	437 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNOT1-222	ENST00000570139	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNOT1-222	ENST00000570139	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNOT1-222	ENST00000570139	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNOT1-222	ENST00000570139	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNOT1-222	ENST00000570139	PANK2	Q9BZ23	570 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNOT1-222	ENST00000570139	TRIM9	Q9C026	710 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNOT1-222	ENST00000570139	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
CNOT1-222	ENST00000570139	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNOT1-222	ENST00000570139	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNOT1-222	ENST00000570139	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNOT1-222	ENST00000570139	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNOT1-222	ENST00000570139	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF785	A8K8V0	405 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM233	B4DJY2	109 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	TISP43	B9A030	160 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139		B9A039	149 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	FCHO1	O14526	889 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	ACTL6B	O94805	426 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	LYPLA2	O95372	231 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	WNT3	P56703	355 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	AP2B1	P63010	937 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	UBXN2A	P68543	259 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	ASIC1	P78348	528 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	MYL5	Q02045	173 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	APBA1	Q02410	837 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	UBE3A	Q05086	875 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	NEDD9	Q14511	834 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	PCOLCE	Q15113	449 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	CFHR4	Q92496	578 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	HTRA1	Q92743	480 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	SCAMP4	Q969E2	229 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	SYT3	Q9BQG1	590 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	MRI1	Q9BV20	369 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	OR10A2	Q9H208	303 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	EXOC1	Q9NV70	894 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139		A0A087WZ62	844 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	BICDL2	A1A5D9	508 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139		A6NCN8	305 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	RAB27B	O00194	218 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	TPM3	P06753	285 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	PLA2G4B	P0C869	781 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	AR	P10275	920 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	CYP2C9	P11712	490 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	ATF2	P15336	505 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	KCNA2	P16389	499 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	SCP2	P22307	547 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	CDC25A	P30304	524 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	ABCD1	P33897	745 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	CD97	P48960	835 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	GZMK	P49863	264 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	CPT1A	P50416	773 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	7.57	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	CUL4B	Q13620	913 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	IQCB1	Q15051	598 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	INSC	Q1MX18	579 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CNOT1-222	ENST00000570139	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2

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