RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 NOX5Q96PH1 765 aa7.4□□□□□ -1.22
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC2A13Q96QE2 648 aa7.4□□□□□ -1.22
CCNDBP1-212ENST00000567690 OMDQ99983 421 aa7.4□□□□□ -1.22
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa7.4□□□□□ -1.22
CCNDBP1-212ENST00000567690 SIK2Q9H0K1 926 aa7.4□□□□□ -1.22
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCED1AQ9H1Q7 454 aa7.4□□□□□ -1.22
CCNDBP1-212ENST00000567690 NEUROG2Q9H2A3 272 aa7.4□□□□□ -1.22
CCNDBP1-212ENST00000567690 PDCL3Q9H2J4 239 aa7.4□□□□□ -1.22
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CCNDBP1-212ENST00000567690 VANGL2Q9ULK5 521 aa7.4□□□□□ -1.22
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CCNDBP1-212ENST00000567690 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa7.4□□□□□ -1.22
CCNDBP1-212ENST00000567690 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa7.4□□□□□ -1.22
CCNDBP1-212ENST00000567690 FHOD1Q9Y613 1164 aa7.4□□□□□ -1.22
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CCNDBP1-212ENST00000567690 PAGE1O75459 146 aa7.39□□□□□ -1.23
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
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CCNDBP1-212ENST00000567690 RDXP35241 583 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
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CCNDBP1-212ENST00000567690 C21orf59P57076 290 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPP2CBP62714 309 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPP2CAP67775 309 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 AUHQ13825 339 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 KCNJ12Q14500 433 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF423Q2M1K9 1284 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACCSLQ4AC99 568 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 EFHC1Q5JVL4 640 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 MIIPQ5JXC2 388 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 IL27RAQ6UWB1 636 aa7.39□□□□□ -1.23
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CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC26A9Q7LBE3 791 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
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CCNDBP1-212ENST00000567690 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 PTPRN2Q92932 1015 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM129BQ96TA1 746 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 TBCBQ99426 244 aa7.39□□□□□ -1.23
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CCNDBP1-212ENST00000567690 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 MUC3BQ9H195 1237 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 NUP62CLQ9H1M0 184 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 NDST4Q9H3R1 872 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 EBF2Q9HAK2 575 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 PIGVQ9NUD9 493 aa7.39□□□□□ -1.23
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CCNDBP1-212ENST00000567690 TAB2Q9NYJ8 693 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCDHGC3Q9UN70 934 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 HS3ST4Q9Y661 456 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCNX2A6NKB5 2137 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRRC72A6NJI9 287 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 CBX4O00257 560 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 WNT9AO14904 365 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 FLRT2O43155 660 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 SNAP91O60641 907 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 CBFA2T3O75081 653 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 CNTN5O94779 1100 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRIM16O95361 564 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADCY5O95622 1261 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADH1BP00325 375 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 WNT1P04628 370 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC2A3P11169 496 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF18P17022 549 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 NNMTP40261 264 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 CTSKP43235 329 aa7.38□□□□□ -1.23
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADPRHP54922 357 aa7.38□□□□□ -1.23
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