RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SCD5Q86SK9 330 aa21.84■■□□□ 1.09
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LINC00523Q86TU6 105 aa21.84■■□□□ 1.09
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MON1AQ86VX9 555 aa21.84■■□□□ 1.09
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATPAF2Q8N5M1 289 aa21.84■■□□□ 1.09
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PTPRN2Q92932 1015 aa21.84■■□□□ 1.09
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATP2A3Q93084 1043 aa21.84■■□□□ 1.09
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CERS2Q96G23 380 aa21.84■■□□□ 1.09
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MYLK2Q9H1R3 596 aa21.84■■□□□ 1.09
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZFATQ9P243 1243 aa21.84■■□□□ 1.09
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 B4GALT3O60512 393 aa21.83■■□□□ 1.09
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 JCHAINP01591 159 aa21.83■■□□□ 1.09
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCNB1P14635 433 aa21.83■■□□□ 1.09
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MANEALQ5VSG8 457 aa21.83■■□□□ 1.09
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa21.83■■□□□ 1.09
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC91Q7Z6B0 441 aa21.83■■□□□ 1.09
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NUP93Q8N1F7 819 aa21.83■■□□□ 1.09
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KLHL29Q96CT2 875 aa21.83■■□□□ 1.09
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CAPNS2Q96L46 248 aa21.83■■□□□ 1.09
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CPNE1Q99829 537 aa21.83■■□□□ 1.09
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa21.83■■□□□ 1.09
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CHKBQ9Y259 395 aa21.83■■□□□ 1.09
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa21.83■■□□□ 1.09
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 USP1O94782 785 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OR4Q2P0C623 313 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC2A3P11169 496 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NQO1P15559 274 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GP5P40197 560 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAGEA11P43364 429 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GRTP1Q5TC63 336 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NLRP9Q7RTR0 991 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UNC5BQ8IZJ1 945 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARMC2Q8NEN0 867 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DPF3Q92784 378 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CASP10Q92851 521 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ERP27Q96DN0 273 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IL22Q9GZX6 179 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FNIP2Q9P278 1114 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADAM28Q9UKQ2 775 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NEU3Q9UQ49 428 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 A0A1W2PQH9 124 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DFFAO00273 331 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GLRA3O75311 464 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UNC5CO95185 931 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MSANTD2Q6P1R3 559 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LRRC8DQ7L1W4 858 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM135Q86UB9 458 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LRRC49Q8IUZ0 686 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PARP9Q8IXQ6 854 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 STKLD1Q8NE28 680 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SIRPGQ9P1W8 387 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OR6C75A6NL08 312 aa21.81■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KCNU1A8MYU2 1149 aa21.81■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARVCFO00192 962 aa21.81■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CACNG3O60359 315 aa21.81■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ITGA2BP08514 1039 aa21.81■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SELPP16109 830 aa21.81■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NUDCD3Q8IVD9 361 aa21.81■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ABI1Q8IZP0 508 aa21.81■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANKLE1Q8NAG6 615 aa21.81■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 E2F7Q96AV8 911 aa21.81■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DCDC2Q9UHG0 476 aa21.81■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MSI1O43347 362 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 INHAP05111 366 aa21.8■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PDE1BQ01064 536 aa21.8■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CDH17Q12864 832 aa21.8■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LHX8Q68G74 356 aa21.8■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa21.8■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C1orf74Q96LT6 269 aa21.8■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C7orf26Q96N11 449 aa21.8■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NMUR1Q9HB89 426 aa21.8■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TLR6Q9Y2C9 796 aa21.8■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HGSO14964 777 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MGRN1O60291 552 aa21.79■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 USP12O75317 370 aa21.79■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANXA9O76027 345 aa21.79■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ERVK-10P10266 1014 aa21.79■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TUBP50607 506 aa21.79■■□□□ 1.08
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARFIP2P53365 341 aa21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms