RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	MLH1	P40692	756 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	PEX19	P40855	299 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGAP25	P42331	645 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	LOXL3	P58215	753 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	AP2B1	P63010	937 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TMF1	P82094	1093 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CREB5	Q02930	508 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TFCP2	Q12800	502 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC12A1	Q13621	1099 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD1	Q15327	319 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM60	Q495X7	471 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957		Q4G0T1	1027 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TREML2	Q5T2D2	321 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ISM2	Q6H9L7	571 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	IQCA1	Q86XH1	822 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	AVL9	Q8NBF6	648 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	MAML1	Q92585	1016 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	RILPL2	Q969X0	211 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	COG8	Q96MW5	612 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	REEP2	Q9BRK0	252 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	RTKN	Q9BST9	563 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	HMX3	A6NHT5	357 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	AGAP14	A8MT82	685 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	BTN3A1	O00481	513 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	PIP5K1B	O14986	540 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	NTSR2	O95665	410 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	NDST3	O95803	873 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CLEC3B	P05452	202 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	P4HA1	P13674	534 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	IL1R1	P14778	569 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	IL1R2	P27930	398 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP2C18	P33260	490 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ARL3	P36405	182 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	NNMT	P40261	264 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	PSMB10	P40306	273 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNJ5	P48544	419 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	HTR6	P50406	440 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ALDH3A2	P51648	485 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	LILRA4	P59901	499 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP4F2	P78329	520 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	BFSP1	Q12934	665 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CHAF1B	Q13112	559 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC13A2	Q13183	592 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP2R5C	Q13362	524 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CUL4B	Q13620	913 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB32	Q13637	225 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM29	Q14134	588 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		3.04	□□□□□ -1.92

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