RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557652.1

SUPT16H-208, Transcript of SPT16 homolog, facilitates chromatin remodeling subunit, humanhuman

TSL 5

Gene SUPT16H, Length 877 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT16H-208ENST00000557652 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa14.5□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 SHROOM3Q8TF72 1996 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 LRRD1A4D1F6 860 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 TBC1D3BA6NDS4 549 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 TMEM221A6NGB7 291 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 SHISA7A6NL88 538 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 M0R296 226 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 RAMP2O60895 175 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 ATG13O75143 517 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 RHOCP08134 193 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 TCF4P15884 667 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 GOT1P17174 413 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 SOX9P48436 509 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 SLC20A2Q08357 652 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 TFDP2Q14188 446 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 PON2Q15165 354 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 TAZQ16635 292 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 CA9Q16790 459 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 PLEKHG6Q3KR16 790 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 ALFQ53S48 1182 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 TXNDC11Q6PKC3 985 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 TMCO3Q6UWJ1 677 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 C12orf40Q86WS4 652 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 ZNF687Q8N1G0 1237 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 NAT16Q8N8M0 369 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 DCAF4L2Q8NA75 395 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 PJA1Q8NG27 643 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 TTC17Q96AE7 1141 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 HES6Q96HZ4 224 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 CALN1Q9BXU9 219 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 ABCB8Q9NUT2 735 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 MPP6Q9NZW5 540 aa14.49□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 DCLK1O15075 740 aa14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 CNTN5O94779 1100 aa14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 KRT1P04264 644 aa14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 ERCC2P18074 760 aa14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 GGCXP38435 758 aa14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 SLC6A11P48066 632 aa14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 PEX5P50542 639 aa14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 NUBP1P53384 320 aa14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 GNA12Q03113 381 aa14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 LMAN2Q12907 356 aa14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 TFDP3Q5H9I0 405 aa14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 TMCO4Q5TGY1 634 aa14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 FSTL4Q6MZW2 842 aa14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 TTC8Q8TAM2 541 aa14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 BHMTQ93088 406 aa14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 MYEOVQ96EZ4 313 aa14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 RNF157Q96PX1 679 aa14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 FEM1AQ9BSK4 669 aa14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 ELOVL2Q9NXB9 296 aa14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 HPCAL4Q9UM19 191 aa14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 SIT1Q9Y3P8 196 aa14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 JRKLQ9Y4A0 524 aa14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 SNX10Q9Y5X0 201 aa14.48□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 TRIOO75962 3097 aa14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 A0A0U1RQJ8 604 aa14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 ARHGAP42A6NI28 874 aa14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 FAM170BA6NMN3 283 aa14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 DLDP09622 509 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 CHRNB1P11230 501 aa14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 AOC1P19801 751 aa14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 IL4RP24394 825 aa14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 TARSP26639 723 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 GJC1P36383 396 aa14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 NNMTP40261 264 aa14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 NR2C2P49116 596 aa14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 CLCN6P51797 869 aa14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 ZNF33AQ06730 810 aa14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 UBXN2BQ14CS0 331 aa14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 RPS6KA1Q15418 735 aa14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 PITRM1Q5JRX3 1037 aa14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 MEI1Q5TIA1 1274 aa14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 MBLAC2Q68D91 279 aa14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 RETSATQ6NUM9 610 aa14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 ADIPOR2Q86V24 386 aa14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 ATRIPQ8WXE1 791 aa14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 RAPGEF5Q92565 580 aa14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 ALG14Q96F25 216 aa14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 P2RY11Q96G91 374 aa14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 BRD8Q9H0E9 1235 aa14.47□□□□□ -0.09
SUPT16H-208ENST00000557652 MUC3BQ9H195 1237 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms