RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557206.1

HIF1A-210, Transcript of hypoxia inducible factor 1 subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene HIF1A, Length 767 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1A-210ENST00000557206 ADAM10O14672 748 aa5.58□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 SYN3O14994 580 aa5.58□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 ANP32CO43423 234 aa5.58□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 CYP4B1P13584 511 aa5.58□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 CPA1P15085 419 aa5.58□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 PRPH2P23942 346 aa5.58□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 CHRNA5P30532 468 aa5.58□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 MAPK9P45984 424 aa5.58□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 PLCD1P51178 756 aa5.58□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 RPS6KA3P51812 740 aa5.58□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 EFR3AQ14156 821 aa5.58□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 GXYLT1Q4G148 440 aa5.58□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa5.58□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.58□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 MDGA2Q7Z553 956 aa5.58□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 RIC8AQ9NPQ8 531 aa5.58□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 THAP1Q9NVV9 213 aa5.58□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 KLQ9UEF7 1012 aa5.58□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 DTX4Q9Y2E6 619 aa5.58□□□□□ -1.52
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HIF1A-210ENST00000557206 WDR91A4D1P6 747 aa5.57□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 NPIPB13A6NJU9 1138 aa5.57□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 SAC3D1A6NKF1 404 aa5.57□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 NPIPB5A8MRT5 1133 aa5.57□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 NPIPB4C9JG80 1138 aa5.57□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 HLA-DQA2P01906 255 aa5.57□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 ACP5P13686 325 aa5.57□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 TMEM95Q3KNT9 176 aa5.57□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 Q4G0T1 1027 aa5.57□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 MTFR2Q6P444 385 aa5.57□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 SLC30A9Q6PML9 568 aa5.57□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 DEF8Q6ZN54 512 aa5.57□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 NANOGP1Q8N7R0 232 aa5.57□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 LINS1Q8NG48 757 aa5.57□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa5.57□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 TXNRD2Q9NNW7 524 aa5.57□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 RASSF1Q9NS23 344 aa5.57□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 UTS2RQ9UKP6 389 aa5.57□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 FBXO4Q9UKT5 387 aa5.57□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa5.57□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 CXorf65A6NEN9 183 aa5.56□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 KCNJ18B7U540 433 aa5.56□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 RHODO00212 210 aa5.56□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 TLR2O60603 784 aa5.56□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 CSF1P09603 554 aa5.56□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 CDK4P11802 303 aa5.56□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 LYL1P12980 280 aa5.56□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 KRTAP1-1Q07627 177 aa5.56□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 COLEC12Q5KU26 742 aa5.56□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 ISM2Q6H9L7 571 aa5.56□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 SHC4Q6S5L8 630 aa5.56□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 SCN4BQ8IWT1 228 aa5.56□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 USP38Q8NB14 1042 aa5.56□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 IP6K1Q92551 441 aa5.56□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 UBXN10Q96LJ8 280 aa5.56□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 PIMREGQ9BSJ6 248 aa5.56□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 RRN3Q9NYV6 651 aa5.56□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 LAMP3Q9UQV4 416 aa5.56□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 BTBD3Q9Y2F9 522 aa5.56□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa5.55□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 TMEM247A6NEH6 219 aa5.55□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa5.55□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 CREB3O43889 395 aa5.55□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 TSPAN3O60637 253 aa5.55□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 FGBP02675 491 aa5.55□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 CYP2J2P51589 502 aa5.55□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 PGM5Q15124 567 aa5.55□□□□□ -1.52
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HIF1A-210ENST00000557206 ALG10BQ5I7T1 473 aa5.55□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa5.55□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 CBWD5Q5RIA9 395 aa5.55□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 C10orf25Q5T742 122 aa5.55□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 CYP26C1Q6V0L0 522 aa5.55□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa5.55□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 GALNT7Q86SF2 657 aa5.55□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 IGFN1Q86VF2 1251 aa5.55□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 EXD3Q8N9H8 876 aa5.55□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 SLC44A5Q8NCS7 719 aa5.55□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 PIGOQ8TEQ8 1089 aa5.55□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 STAMQ92783 540 aa5.55□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 AAMDCQ9H7C9 122 aa5.55□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 ACAD9Q9H845 621 aa5.55□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa5.55□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 METTL18O95568 372 aa5.54□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 LCKP06239 509 aa5.54□□□□□ -1.52
HIF1A-210ENST00000557206 WEE2P0C1S8 567 aa5.54□□□□□ -1.52
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