RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556591.1

CFAP54-208, Transcript of cilia and flagella associated protein 54, human

TSL 5

Gene CFAP54, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFAP54-208	ENST00000556591	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CFAP54-208	ENST00000556591	PKP3	Q9Y446	797 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CFAP54-208	ENST00000556591	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CFAP54-208	ENST00000556591	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CFAP54-208	ENST00000556591	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CFAP54-208	ENST00000556591	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CFAP54-208	ENST00000556591	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CFAP54-208	ENST00000556591	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CFAP54-208	ENST00000556591	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CFAP54-208	ENST00000556591	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CFAP54-208	ENST00000556591	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CFAP54-208	ENST00000556591	RXRA	P19793	462 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CFAP54-208	ENST00000556591	NR4A2	P43354	598 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CFAP54-208	ENST00000556591	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CFAP54-208	ENST00000556591	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CFAP54-208	ENST00000556591	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CFAP54-208	ENST00000556591	RNF144B	Q7Z419	303 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CFAP54-208	ENST00000556591	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CFAP54-208	ENST00000556591	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CFAP54-208	ENST00000556591	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CFAP54-208	ENST00000556591	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CFAP54-208	ENST00000556591	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CFAP54-208	ENST00000556591	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CFAP54-208	ENST00000556591	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CFAP54-208	ENST00000556591	THSD1	Q9NS62	852 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CFAP54-208	ENST00000556591	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CFAP54-208	ENST00000556591	FEM1B	Q9UK73	627 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CFAP54-208	ENST00000556591		A0A0G2JK05	382 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	KCNJ18	B7U540	433 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	RHOD	O00212	210 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	5.08	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	CSF1	P09603	554 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	LMO1	P25800	156 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	AVPR2	P30518	371 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	ARL4C	P56559	192 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	GALNT3	Q14435	633 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	KLB	Q86Z14	1044 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	TRMO	Q9BU70	441 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	KL	Q9UEF7	1012 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	SOCS2	O14508	198 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	STX16	O14662	325 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	TK1	P04183	234 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	PTGER1	P34995	402 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	ME1	P48163	572 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	PLCD1	P51178	756 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	RHAG	Q02094	409 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	DLGAP5	Q15398	846 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	ISM2	Q6H9L7	571 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	RFX8	Q6ZV50	586 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	LINS1	Q8NG48	757 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	ACAD9	Q9H845	621 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	THAP1	Q9NVV9	213 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591		A6NNC1	897 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	IRAK2	O43187	625 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	SEPT4	O43236	478 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	ATG13	O75143	517 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	NEURL1	O76050	574 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	NDUFB8	O95169	186 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	CHRNB1	P11230	501 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	KLRC2	P26717	231 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	GSTM2	P28161	218 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	TYK2	P29597	1187 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	ACTR2	P61160	394 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CFAP54-208	ENST00000556591	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6

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