RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 MPP6Q9NZW5 540 aa21.49■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 PILRBQ9UKJ0 227 aa21.49■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa21.49■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa21.49■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 E9PAM4 449 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 SIN3BO75182 1162 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 CLDN11O75508 207 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 MOCS3O95396 460 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 SDC4P31431 198 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 CDH4P55283 916 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 HDAC4P56524 1084 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 SLC12A1Q13621 1099 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 ARID5BQ14865 1188 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 C9orf64Q5T6V5 341 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 ACAD10Q6JQN1 1059 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 MCOLN2Q8IZK6 566 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 KDM1BQ8NB78 822 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 HSPA12BQ96MM6 686 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 HAPLN3Q96S86 360 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 HAUS4Q9H6D7 363 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 ZNF212Q9UDV6 495 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 ITIH6Q6UXX5 1313 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 NUP205Q92621 2012 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 NUMA1Q14980 2115 aa21.47■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 LNP1A1A4G5 178 aa21.47■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 SIGLEC16A6NMB1 481 aa21.47■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 SLC30A4O14863 429 aa21.47■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 CCDC172P0C7W6 258 aa21.47■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 VAV1P15498 845 aa21.47■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 RRM1P23921 792 aa21.47■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 PRKCIP41743 596 aa21.47■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 ST8SIA6P61647 398 aa21.47■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 ZNF33AQ06730 810 aa21.47■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa21.47■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 SYT12Q8IV01 421 aa21.47■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 PSMB7Q99436 277 aa21.47■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 SELENOOQ9BVL4 669 aa21.47■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 SUN2Q9UH99 717 aa21.47■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.031e-14■■□□□ 14.3
CS-222ENST00000550996 SKILP12757 684 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 TNFAIP3P21580 790 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 ADRA1BP35368 520 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 UBASH3AP57075 661 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 IRX4P78413 519 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 OGDHQ02218 1023 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 FIGNQ5HY92 759 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 MANEALQ5VSG8 457 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 SFMBT2Q5VUG0 894 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 DNAJC24Q6P3W2 148 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 STRADAQ7RTN6 431 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 FAM124AQ86V42 546 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 CCDC185Q8N715 623 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 FRS2Q8WU20 508 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 FAM172AQ8WUF8 416 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 MCEEQ96PE7 176 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 GPR174Q9BXC1 333 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 EDEM3Q9BZQ6 932 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 FBRSQ9HAH7 460 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 TMEM51Q9NW97 253 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 NEU3Q9UQ49 428 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-222ENST00000550996 DCDC2BA2VCK2 349 aa21.45■■□□□ 1.02
CS-222ENST00000550996 TMCO5BA8MYB1 307 aa21.45■■□□□ 1.02
CS-222ENST00000550996 FAM72CH0Y354 149 aa21.45■■□□□ 1.02
CS-222ENST00000550996 SRGAP2O75044 1071 aa21.45■■□□□ 1.02
CS-222ENST00000550996 NDUFS2O75306 463 aa21.45■■□□□ 1.02
CS-222ENST00000550996 ACADMP11310 421 aa21.45■■□□□ 1.02
CS-222ENST00000550996 GPD1P21695 349 aa21.45■■□□□ 1.02
CS-222ENST00000550996 LIMK1P53667 647 aa21.45■■□□□ 1.02
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CS-222ENST00000550996 TPM4P67936 248 aa21.45■■□□□ 1.02
CS-222ENST00000550996 FAM72AQ5TYM5 149 aa21.45■■□□□ 1.02
CS-222ENST00000550996 FAM72DQ6L9T8 149 aa21.45■■□□□ 1.02
CS-222ENST00000550996 FAM72BQ86X60 149 aa21.45■■□□□ 1.02
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CS-222ENST00000550996 FAM129BQ96TA1 746 aa21.45■■□□□ 1.02
CS-222ENST00000550996 EDEM2Q9BV94 578 aa21.45■■□□□ 1.02
CS-222ENST00000550996 IFNKQ9P0W0 207 aa21.45■■□□□ 1.02
CS-222ENST00000550996 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CS-222ENST00000550996 VPS28Q9UK41 221 aa21.45■■□□□ 1.02
CS-222ENST00000550996 A0A0D9SEW6 157 aa21.44■■□□□ 1.02
CS-222ENST00000550996 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa21.44■■□□□ 1.02
CS-222ENST00000550996 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa21.44■■□□□ 1.02
CS-222ENST00000550996 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CS-222ENST00000550996 CCP110O43303 1012 aa21.44■■□□□ 1.02
CS-222ENST00000550996 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
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